当您辛辛苦苦拿到丰富的数据信息时
您为海量数据迷惑苦于不知从何着手吗?
您面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用吗?
……
来这里吧,
华大基因将帮你探索生命的奥秘。
这里有良师:
由经历了1%人类基因组,水稻,家蚕和家鸡基因组分析的国际一流的生物信息专家为您讲解
这里有益友:
志同道合的学友在深具个性魅力的华大教师团队的带领下,形成浓厚的学习氛围,能给您提供良好的意见,开拓思路。
您将得到以下知识和技能充实自己:
1. 熟练掌握生物信息学种常用软件的下载、安装及使用;
2. 具备独立分析基因组数据的能力,如组装、基因预测、功能注释、重复序列分析、SNP分析、进化相关分
析等。
3. 熟悉常用公共数据库的内容及特点,能够快速的进行检索查询以及数据下载。
4. 我们还可根据您实验室的具体问题提供相应的软硬件分析解决方案,建立起您自己的生物信息分析实验室。
培训班的优势:
1、从基本的生物学问题出发,结合具体实例,实实在在的分析数据。
2、灵活的“个性化”课程安排:当您因为出差、课时冲突等等各种原因无法参加某一课时,我们会为您保留
资格,您可以在我们全年的课程中自由选择自己的合适时间以及喜好的特定课程参与。
招生对象:
任何想了解生物信息学的人。
课程安排:
时间 |
课程内容 |
具体内容 |
一 |
常用生物数据及数据库介绍 |
NCBI
UCSC
ENSEMBL
EBI/SWISSPROT
Kegg
Rice/Silkworm |
Unix/Linux操作系统介绍 |
Unix/Linux基础知识及常用命令 |
二 |
数据的基本处理及序列的组装 |
(1) Sanger法测序及新的测序技术介绍
(2) 数据的基本处理
峰图转换(phred,phd2fasta)
载体屏蔽(crossmatch)
聚类拼接(phrap\cap3\consed\Reps)
补洞/引物设计:Primer3 |
三 |
序列的比对 |
(1) 全局比对
Clustalw,Muscle,Hmmer
(2) 局部比对
Blast,Blat,Sim4,Genewise |
四 |
基因组/基因注释分析 |
(1) 重复序列分析
RepeatMasker,TRF
(2) RNA分析
tRNA,rRNA,microRNA,snoRNA
(3) 基因预测
原核:Glimmer
真核:Genescan,Fgenesh,BGF
(4) 基因功能注释
NT,NR,SwissProt,Kegg,COG
Interpro&GO
(5) 启动子及motif 预测
PromoterScan
Meme/Mast |
五 |
SNP多态性分析 |
Polyphred |
分子进化分析 |
Phylip,PAML,FGF,KaKs_calculator |
六 |
表达序列标签(EST)分析 |
(1) EST数据的基本处理
(2) 差异表达分析
(3) 功能注释及分类 |
七 |
生物芯片(Microarray)数据分析 |
芯片数据分析
Oligo设计 |
蛋白质结构预测分析 |
信号肽分析
跨膜区结构预测
Domain预测
二级/三级结构预测 |
八 |
新的测序技术及其应用 |
新的测序技术及其应用 |
结业典礼 |
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注:课程安排时间为工作日,我们一般每月的第一个星期开课,全部课程需要九个工作日,所以
要跨两个星期,星期间的周末(六日)休息,课程依次顺延,我们会根据实际情况有所调整。 |
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