第一届病原微生物专题培训班

       单细胞测序是指通过对单个细胞进行基因组、转录组及表观基因组水平的测序,获得相应数据并进行信息分析的技术。单细胞测序可以解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,为解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系等提供了新方法。
       近年来,单细胞生物学成为了非常热门的研究方向,而在这一领域中,最前沿的则是单细胞测序技术。19年上半年,华大基因学院开设的第一期《单细胞组学实用技术分析培训班》就受到了各界学员的热捧。
       为了满足大家对该专题的培训需求,华大基因学院在对上期培训的经验进行总结改进的基础上,特再次开设单细胞专题培训,将华大宝贵的前沿技术经验分享给各位同仁。

培训时间:2019年11月14-17日
培训地点:深圳 华大总部11栋
主办单位:华大基因学院

【培训对象】
  • 从事单细胞研究(如利用单细胞技术进行癌症,发育,疾病机制,以及表观基因组学研究)的科研工作者和高校师生。
  • 对单细胞技术感兴趣,希望通过集中专题学习扩展思路,将该技术应用于自己项目的研究人员。
【培训目标】
帮助学员学习掌握:
  • 单细胞转录组测序的基础分析以及高级数据分析
  • 多组学科学研究思路、项目设计方法
  • 多组学整合分析
【培训优势】
  • 一流的讲师——丰富的科研经验、重大项目执行经验
  • 全面的课程——技术原理、分析流程&技术应用相互结合
  • 全新的方法——使用开源的软件&分析流程,更方便、快捷
  • 面对面解决问题——与信息分析、数据挖掘达人面对面探讨项目中的瓶颈问题
【课程内容】
日期 上课时间 课程 内容
11月14 日
第一天
8:30-9:00 签 到
9:00-12:00 1.科研项目设计 1.1 单细胞组学技术发展历程和原理介绍
1.2 单细胞组学技术在科研中的应用:设计思路和案例介绍
1.3 单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍
14:00-15:00 2.单细胞建库原理与操作 2.1 样本获取和保存
2.2 单细胞实验处理、建库、测序
15:15-18:00 3.R安装、数据处理分析与绘图 3.1 R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明
11月15日
第二天
9:00-18:00 3.2 R语言语法介绍及常用命令
3.3 数据处理功能及统计应用
3.4 R语言画图实操及ggplot2介绍、实操
4.单细胞转录组绘图和结果解读 4.1 聚类分析(Seurat v2或v3)
4.2 差异表达分析(DEG)
4.3 marker gene等高级分析
11月16日
第三天
9:00-18:00 4.4 时序分析(monocle2)
5.单细胞表观基因组分析(scATAC-seq) 5.1 聚类分析
5.2 调控等分析
11月17日
第四天
9:00-12:00 6.案例实操与详解 6.1 一个case(包括RNA和ATAC)的大作业实操与讲解
14:00- 17:00 深圳国家基因库参观考察  OR  课堂答疑

【注】 :深圳市华大基因学院保留对以上课程信息进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。

【讲师团队】

刘石平遗传学博士,2015年毕业于华南理工大学。自2009年加入华大研究院,从事单细胞基因组学、群体遗传学、比较基因组学等生物信息研究工作8年多。参与众多国际重大的基因组学重大科研项目,如大熊猫基因组、北极熊群体基因组、G10K、癌症单细胞计划、Human Cell Atlas等。曾获中国青少年科技创新奖,深圳市高层次人才,深圳市盐田区生物产业高层次人才(优秀人才)。目前主要研究单细胞多组学、脑科学等前沿领域。近五年已发表SCI论文14篇,其中Cell, Nature, Science (CNS)7篇,以第一作者或并列第一作者发表论文5篇。

刘龙奇,细胞生物学博士现任华大生命科学研究院单细胞组学实验室负责人。同时担任西北大学兼职教授,郑州大学兼职副教授,华大基因学院高级讲师。曾获中科院院长奖学金,深圳市高层次人才,深圳市盐田区“梧桐人才”。目前主要负责高通量单细胞多组学测序新技术和产品研发工作,在细胞命运转变,表观遗传学,基因表达调控,单细胞多组学整合分析等方面具有丰富的经验。近5年来以第一或通讯作者在Cell Stem Cell, Nature Materials, Nature Communications等杂志上发表论文或评论多篇。

石泉  哥本哈根大学在读博士。2011年加入华大生命科学研究院并从事信息分析研究工作至今。研究领域为非编码突变解读,以及利用单细胞转录组和表观基因组测序技术进行肝细胞再生机制研究。曾参与多个单基因病检测项目,分析并交付临床样品超过2万例,领导开发华大内部通用注释框架。发表SCI论文9篇,发明专利1项,软件著作权3项。

夏军,华大智造项目经理。主要负责胚胎植入前检测以及单细胞测序方向产品的研发。先后负责孕妇外周血胎儿有核红细胞分离应用,胚胎植入前遗传传学筛查试剂盒开发、胚胎植入前胚胎单基因病和染色体异常一体化检测技术开发与stLFR建库试剂盒开发等项目。
已发表SCI文章3篇,申请专利4项。在胚胎植入前检测和单细胞建库测序方向有丰富的经验。

【注册费】
注册费:5000元/人
1.费用包括学费、资料费、实操练习费、其他材料费及午餐费;
2.培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理;

【优惠政策】
1、华大培训及业务合作老客户,可享9.5折,即4750元/人;
2、转发分享此文到朋友报名,可享9折优惠,即4500元/人;
3、5人及以上团体报名,可享8折优惠,即4000元/人;
* 以上优惠不能同时使用,最终解释权归华大学院所有

【报名方式】
线上报名:


扫描扫描二维码,填写信息并支付,即为报名成功

【注意事项】
1. 报到通知
    报名成功者,将会在11月7号18:00之前收到会务组的邮件报到通知。
2. 发票
    2019年11月7日18:00前付款可在培训期间获取发票。
    请务必准确填写报名表单的发票信息,因个人填写信息错误导致发票有误,不予重开!发票信息建议提前与贵
    单位财务部门确认。
3. 结业证书
    完成培训的学员,将获得由深圳市华大基因学院颁发的结业证书。
4. 自备笔记本电脑
    CPU 2G以上,内存4G以上,电脑有无线网卡或连接有线网络的端口

【联系方式】
咨询电话:0755-36352044
咨询时间:周一至周五  9:00-18:00
咨询邮箱:training@service.genomics.cn


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