2021中国整合生物样本学大会暨第八届中国生物样本库院长高峰论坛将于2021年4月8日—4月10日在中国•上海召开。届时,安捷伦将携其自动化电泳系列产品强力助阵。
作为转化医学研究的重要疾病资源,生物样本库的规范建设、科学管理和可持续发展日益受到重视。对于样本库的管理而言,其样本的质控需贯穿在样本的整个生命过程中。
- 源头的质控有助于对采集到的样本进行分级,不同类型的疾病样本如血液、组织、体液等根据其生物学特性得到了正确的处理和保存,从而避免入库样本的质量偏倚和资源浪费。
- 过程的质控有助于评估生物样本库的保存条件是否得当,尤其是更换实验流程和储存系统时,更需要定期进行回顾性分析,确保样本可以得到很好的长期保存。
- 成果的反馈管理对于进入产出阶段的样本库至关重要,有助于样本库总结经验和教训,利用成果争取更多样本库建设资源,形成“高质量样本库一支撑转化医学研究一更高质量的样本库”的正反馈,以保证样本库的可持续发展。
Heidelberg CardioBiobank (HCB)是德国最大的生物样本库之一,重点关注心血管疾病。同时也作为多个国家和国际临床试验和研究项目的核心生物样本库。2014年,HCB对样本库系统进行了重组和改进,建立了一个大型的、全自动的-80 ℃存储系统,容量高达120万个样品,并引进了安捷伦TapeStation 4150,在样本采集和管理过程中进行质控,以确保能够储存最合适的样本以及选择最适合的储存条件,进一步保证了利用样本开展转化医学研究结果的可靠性与科学性。
HCB样本处理流程
在HCB的一项回顾性分析中,详细阐述了安捷伦TapeStation 4150在生物样本库的管控系统中发挥的重要作用。
实验设计:
- 对-80℃保存了9年且无反复冻融的DNA样本质量进行分析。从2010到2018,对每年的入库样本随机抽取20例。
- 2014年前是手工柱膜法提取,2015年后自动化提取。借此结果评估提取方法的影响。
结果和结论:
- 9年间样品质量的比较。使用安捷伦基因组DNA筛查法对每年的20份DNA样本进行分析。2014年,由于提取方法的改变,对两组进行了分析。
- 选取2010年至2018年的代表性样本进行比较。样品完整性在2015年后有所提高,表现为较高的DIN值。
- 用Quantus荧光仪和Agilent 4150自动化电泳系统测定每年代表性样本的DNA浓度。2014 - 2015年DNA浓度的增加是手工提取转向自动化提取的结果。
由于2015年流程的重大改进,HCB对样本收集、运输和制备等工作流程进行了评估。通过自动化DNA提取过程,可以显著提高DNA的质量和浓度。使用安捷伦自动化电泳系统进行分析,可以很好地给出DNA的质量和浓度结果,提供样本处理和保存流程是否得当的质控依据。
如今,个性化和精准医疗的需求非常明显,“garbage in equals garbage out”,我们需要使用最佳样本进行转化研究。Agilent 自动化电泳系统可以顺利集成到生物样本库的工作流程中,作为可靠的质控工具,验证对下游应用很重要的核酸样本的质量。
广为世界生物银行喜爱的Agilent QC产品究竟长什么样呢?
在高颜值的加持下,Agilent QC天团的性能也非常能打:
Agilent 2100生物分析仪系统
利用芯片实验室电泳技术分离 DNA、RNA 和蛋白质样品,适用于任何QC工作流程。
Agilent TapeStation系统
易于使用的解决方案,能够快速、精确地评估 DNA 和 RNA 样品,每个样品仅需1–2 分钟。
– 4150 TapeStation系统:一次最多能够分析16个样品,适合低通量实验室
– 4200 TapeStation系统:一次可运行多达96个样品,适合高通量工作流程
安捷伦片段分析仪系统
用于核酸分析的平行毛细管电泳仪,适合各种应用和通量。
– 5200片段分析仪系统:采用12毛细管阵列,可运行低通量、中等通量的工作流程
– 5300片段分析仪系统:可选择48毛细管阵列或96毛细管阵列,适合高通量、超高通量的工作流程
– 5400片段分析仪系统:完全自动化集成的96毛细管阵列,可实现超高通量工作流程
Agilent Femto Pulse系统
市面上唯一一款自动化脉冲场电泳仪,在1.5h内即可完成大片段基因DNA分析,并实现超高灵敏度DNA和RNA检测。
想不想近距离接触我们的QC天团呢,机会来了,安捷伦将携QC天团出席2021中国整合生物样本学大会(4月8日-10日,上海富悦大酒店),届时欢迎莅临安捷伦展位,与QC天团亲密互动,更有精美礼品等您来拿!
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