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导语:表观遗传学和基因组学研究都是近年来十分热门的研究方向, 随着基因组学的发展,表观遗传学的研究也开启了一个新的研究领域:表观基因组学研究。这一研究领域利用新一代测序平台为基础,结合经典的表观遗传学方法,分析各种表观遗传修饰……

专访贺竹梅研究组:表观基因组学研究

来自中山大学生命科学学院的研究人员,与深圳华大基因合作,利用基因组DNA甲基化检测黄金方法Bisulfite Sequencing (BS-Seq),对黄曲霉全基因组DNA甲基化进行了测序,首次证明黄曲霉是一种缺乏DNA甲基化的生物。

这是在世界上第一次使用黄金标准方法—Bisulfite Sequencing研究曲霉属真菌全基因组DNA甲基化状态的报道,也是第三种被证实的缺乏DNA甲基化的生物(前两种分别是果蝇和面粉甲虫)。为了更深入的了解这一重要的表观基因组学研究成果,生物通特联系了中山大学贺竹梅教授研究组,就读者感兴趣的问题请教了贺竹梅教授和他的研究生林剑青同学……




      什么是BS-Seq测序方法? 


这项研究采用了目前公认的基因组DNA甲基化检测黄金方法――BS-Seq测序方法,对黄曲霉全基因组DNA甲基化进行了测序,并从基因进化和基因组序列差异的角度对黄曲霉缺乏DNA甲基化的机制进行了分析,那么这种测序方法具有哪些优点呢?研究组为何选择了这种方法呢?

林剑青同学表示,“Bisulfite处理测序是目前公认的对DNA甲基化状态进行分析的黄金标准。其原理是,对DNA进行Bisulfite处理之后,DNA中未甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),而甲基化的C则保持不变。对处理转化之后的产物进行高通量测序,并与未经Bisulfite处理的原始基因组序列进行分析比较,从而获得整个基因组DNA甲基化状态的信息……

      黄曲霉研究进展: 


一种蛋白质可生成黄曲霉素
研究人员在《自然》杂志上发表论文说,他们研究发现,一种名为PT的蛋白质是导致黄曲霉素产生的关键物质……

多吃青菜可减少黄曲霉毒素对人体的侵害 
花生黄曲霉抗性遗传改良与新品培育获突破 
解读黄曲霉毒素危害

      人物简介: 


贺竹梅

(贺竹梅教授,博客:http://blog.sina.com.cn/geneticshezhumei

贺竹梅教授实验室简介:
贺竹梅教授的主要研究领域为微生物代谢与食品安全。其实验室致力的目标为利用基因组信息、现代遗传学技术、现代微生物学技术和分析化学技术等研究黄曲霉毒素合成代谢的分子遗传学和开发黄曲霉毒素生物控制技术。贺竹梅教授著有《现代遗传学教程》(第2版)(高等教育出版社,2011)等多部著作。

 


      病原菌测序研究新进展: 


华大基因与美国俄勒冈州立大学联手植物疫霉菌基因组研究
疫霉菌(Phytophthora)是一群重要的植物病原菌,由其侵染引起的植物病害统称为“疫病”,该类病菌寄主范围广,传播速度快,能侵染各种林木、果树、花卉、农作物等多种植物……

测序发现结核杆菌在潜伏期同样突变频繁
科学家为齿双歧杆菌测序
新超级病菌基因组被测序
科学家完成对抗药性结核菌的基因测序


      黄曲霉毒素与食品安全: 


广东20家食用油厂产品黄曲霉毒素B1超标
广东省质监局公布粤产食用油专项抽查结果,抽查727家企业中有20家企业的产品黄曲霉毒素B1超标,不合格名单中近九成为无品牌的小加工厂产品。这些不合格的小加工厂采用半精炼工艺,生产量较小,主要以散装形式零售供应附近居民……

蒙牛称牛奶致癌物超标问题饲料来源已查明
蒙牛致癌门事件3点质疑
黄曲霉毒素食用多少会对我们身体产生影响?



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