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真核生物的染色体是由一系列各自独立,又高度有序的染色质结构域构成。这些结构域就是一些独立的基因表达调控单位,在真核生物的基因表达调控扮演着重要的角色,比如DNA拓扑结构变化、DNA碱基修饰变化、组蛋白变化等都具有重要的调控作用。但是至今科学家们对于染色体构架在基因调控中的作用,了解得还很少……



Cell重大成果:人类基因组3D图谱
去年受聘为华中农大“千人计划”专家的阮一骏教授,其研究组一直从事基因组空间结构方面的研究,曾建立了世界先进的基因组学研究方法体系----全基因组双末端标记测序系统(Paired-End-Tag,简称PET)。近期其研究组发表了题为“Extensive Promoter-Centered Chromatin Interactions Provide a Topological Basis for Transcription Regulation”的文章,揭示了基因如何相互作用影响,包括远程相互作用的机制,这将有利于科学家们深入了解人类基因工作的原理,以及探索相关疾病的遗传机制。这一成果公布在Cell杂志上……

     全基因组双末端标记测序系统(Paired-End-Tag,PET)简介: 


类基因组功能元件的深入理解,需要对个体基因组和染色体结构的详细巡查和比对,这就需要对DNA测序的通量和花费进行改进。新一代测序平台将是低花费和高通量的,但其阅读长度较短。这一限制的直接和普遍认可的解决方法就是多种应用的配对末端标签测序,简称为PET测序,从超高通量测序的常DNA片段末端引出短的配对标签。PET测序能够精确地绘制参考基因组,区别PET所在DNA片段的基因组边界和鉴定靶DNA片段。PET测序法已经发展为转录组,转录因子结合位点和染色体结构分析。PET测序技术的独特优点在于能够暴露DNA片段两末端的连接处。由于该优点,PET测序可以解释非传统的融合转录物,染色体结构变化,甚至分子相互作用。



      基因组序列图谱研究进展: 


新碱基随基因组变化图谱出炉
美国埃默里大学医学院和芝加哥大学研究人员合作,绘制出了小鼠大脑中5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)的图谱,显示出该碱基从发育到老化的生命过程中随基因组变化而变化的分布方式……

肠出血性大肠杆菌基因组草图公布
世界首个蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成
游隼和猎隼全基因组序列图谱绘制完成



      国内基因组图谱研究进展 


我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱
中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施的“鲤鱼基因组计划”成功完成了鲤鱼全基因组测序,并绘制了鲤鱼基因组框架图谱……

华东理工大学973项目成果登国际权威期刊
我国科学家完成大黄鱼基因组序列图谱绘制
沪港科学家首次公布珍稀中药材金蝉花全基因组图谱 



      测序技术研究进展: 


全球首台液相定点基因测序仪问世
全球首台液相定点基因测序仪在张江高科技园区问世,这种仪器在癌细胞比例低于20%的样品中,能检测出基因变异,而目前医院使用的基因测序技术,都要求癌细胞数不得低于40%……

基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT 
个人基因组测序之初体验
新一代DNA测序:提高对肌营养不良症的诊断
Cell头条:癌症单细胞测序




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