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人类、草莓、蜜蜂、鸡和大鼠等许多生物体都已经进行过DNA测序。如果说测序个别物种具有挑战性,那么测序单个细胞的DNA无疑更难。为了获得足够的DNA进行测序,通常需要数以千计或甚至数以百万计的细胞。而找出哪种突变存在于哪种细胞中几乎是不可能的,只存在于少数细胞(如早期癌细胞)中的突变也基本上被掩藏。

谢晓亮院士Science单细胞测序新技术
在12月21日《科学》(Science)杂志上一项新技术为我们提供了一种拷贝DNA的途径,从而使得单细胞中90%的基因组能够被测序。这种方法使得检测单细胞中较小的DNA序列变异变得更容易,因此能够发现个别细胞之间的遗传差异。这样的差异可以帮助解释癌症恶化的机制,生殖细胞形成机制,甚至是个别神经元的差异机制。 [详细...]




      单细胞测序:


Nature:单细胞测序(上)
随着技术的飞速发展,成本大大降低,使得基因组测序成为常规技术。然而,大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序,它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。

Nature子刊:癌症单细胞测序新技术
发布在《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上的一项新研究首次表明一种称为Smart-Seq的新基因组测序方法可以帮助科学家们深入分析临床相关的单细胞。Smart-Seq有许多可能的应用,包括帮助科学家们更好地了解肿瘤形成的复杂性。

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员首次公布了来自一个成人男子91个精子的全部基因组序列,这项研究成果第一次绘制了个体基因重组图谱,也首次发现了来自同一个人的不同精子的不同突变率。相关成果公布在Cell杂志上。

华裔NIH创新奖得主Nature获单细胞技术突破
在最近一次的统计中,国际研究团体已对近4000个个体癌症样本进行了测序,并计划到2014年底对至少2.1万个以上的肿瘤基因组开展研究。这些基因组数据集跨越50种不同的癌症类型涵盖几乎机体内的所有器官,通过鉴别区分癌细胞和正常细胞的主要遗传改变为通向多种新的靶向治疗选择开启了大门。



      单细胞的分析 :  


屡发Nature、Science文章,蔡龙走在单细胞技术的前沿
在加州理工学院,化学家蔡龙(Long Cai)正在开发一种新技术扩展在单细胞中可同时追踪的分子的数量。去年,这位崭露头角的加州理工学院(Caltech)的物理化学家获得了美国国家卫生研究院(NIH)的“创新奖”,他正采用一种称作超分辨率条形码(super-resolution barcoding)的技术将基因组学和蛋白质组学应用到单细胞中从而将其投入充分的利用。

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通常情况下,分子生物学研究都是针对组织样本或者一个细胞群来进行。然而,组织样本中一般包含多种类型的细胞,即使来自于同一个细胞群的各个细胞间的基因水平、表达水平会存在不同程度的差异,互为异质细胞。以组织或细胞群为起始样本的研究,可能会因为细胞异质性而获得错误的结果。

多篇Nature文章聚焦单细胞分析技术
微流体PCR和DNA测序让我们能够从大细胞群中挑出单个的细胞进行分析。现在,科学家们正利用新的单细胞分析技术去发现哪些细胞具有哪些蓝图,以及是如何影响它们的表型的

Nature:空前分辨率观测神经细胞活动
近日来自哈佛大学和剑桥大学的研究人员开发了一项新技术,可使他们以单细胞分辨率检测大群神经细胞的活动。这项在斑马鱼中开发的技术为我们提供了一个简单的模型揭示大脑区域是如何协同运作灵活控制行为的。相关论文发布在《自然》(Nature)杂志上。



      测序新技术:  


Nature子刊:突破性测序技术绘制甲基化图谱
通过一种新的DNA测序技术,研究人员首次绘制了致病菌全基因组甲基化标记图谱。通过比较相关菌株之间的甲基化模式,他们发现了称作噬菌体的病毒感染细菌显著改变宿主的一种方式。

Nature子刊:新技术攻克单分子测序大问题
来自冷泉港实验室(CSHL)的一位定量生物学家及同事们开发出了一种融合错误校正新方法攻克了单分子测序的重大问题,可将长读取(long reads)的准确度提高到99.9%。这一研究成果发布在7月1日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。

Science:新型纳米孔测序技术
快速的DNA测序有可能很快成为每个人医疗记录的例行工作的一部分,揭示出过去隐藏在人类基因组30亿个核苷酸碱基中的庞大的信息。《科学》(Science)杂志介绍了在测序技术方面的一些最新的进展。

著名学者Nature biotech携手发布测序新技术
近日来自澳大利亚昆士兰大学、哈佛大学和罗氏Nimblegen公司的研究人员开发了一种靶向RNA测序新技术,并利用这一技术对常规测序无法检测到的微量及瞬时表达人类基因组转录本进行了鉴别和特征分析。相关研究成果在线发表在《自然生物技术》(Nature biotechnology)杂志上。




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