专访赵莉：新的基因从何而来
近日来自加州大学戴维斯分校的研究人员发现了在6株果蝇株系中全部或部分表达的142个转录子，对应于果蝇参考基因组（reference genome）中基因间序列，这第一次利用群体遗传学的方法，尝试探索从头起源的基因在群体中扩散、尚未固定之前的表达和结构，以及这些基因受到的选择和调控情况…… [详细内容]

随着基因组学的发展，研究人员发现不同生物在基因组大小和基因数目上存在巨大的差异。人类有二万多基因，而有的细菌只有几百个基因。这种差异不仅仅在远缘物种中体现，即使在进化关系很近、分歧年代很近的近缘物种中，基因的种类和数目也不尽相同，这说明生物在进化过程中伴随着基因组大小和基因数目的变化……

为了完成这一探索，赵莉博士与她的同事对模式生物黑腹果蝇进行研究。他们对果蝇6个果蝇品系mRNA测序拼装，同时对外群物种进行测序拼装，然后通过一系列的参数比较鉴定了可能的在群体中扩散的从头起源基因……
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除了新的基因从何而来外，还有一个有趣而重要的问题，那就是新的基因为何而来？
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赵莉 博士，现为加州大学戴维斯分校博士后。

实验室简介：David Begun实验室位于加州大学戴维斯分校进化与生态系。

We are interested in understanding the population genetic mechanisms responsible for patterning genomic variation across the genome within and between species. The vast majority of our work uses Drosophila as a model system. Our work spans a wide range of evolutionary genomics approaches, including: 1) using population genetics data from particular classes of genes (i.e., sex-related genes, immunity genes) to make inferences about evolutionary mechanisms, 2) using population genetics data from different classes of nucleotide sites throughout the genome to reveal heterogenous forces acting across these classes, 3) using genetic analysis of particular phenotypes to understand the molecular basis of phenotypic variation, 4) using gene expression data to develop sets of candidate genes for phenotypes we are interested in studying.