微量meRIP-seq,大幅降低样本要求量
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表观生物作为国内较早开展meRIP-seq整体服务的公司,一直致力于优化meRIP技术,只需微量样本即可建库;最近测序和生信分析技术再次升级,分析内容囊括高分文章热门图,促销期间还可免费赠送万元高级分析内容和质谱定量检测!
送样要求
样本类型:
1. 总RNA,500ng--20ug
2. 细胞,数量为5x106~107
3. 组织,质量为10~20mg
样本物种:
仅限人、大小鼠物种,其他物种需评估
表观生物实测数据(部分展示)
图1. Peak在RNA结构上的分布pie图
图2. motif分析结果
图3. Peak在RNA结构上的分布metageneplot图
图4. RNA修饰位点交集韦恩图
图5. 差异RNA修饰水平聚类热图
图6. 多组学关联分析四象限图(RNA-seq与meRIP-seq)
图7. 多组学关联分析累计分布图(RNA-seq与meRIP-seq)
图8. UCSC导出peak序列(与单位点修饰预测分析一致)
图9. IGV基因峰图
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基本分析
1.测序原始reads去接头,质量控制(QC)
2.参考基因组比对(Mapping)
3.富集区域鉴定(PeakCalling)
4.富集区域注释(PeakAnno)
5.lncRNA修饰分析、mRNA修饰分析
6.富集区域metagene plot图、pie plot图、venny图
7.Motif分析
8.Peak基因GO和KEGG分析
9.差异Peak分析(即差异RNA修饰mRNA、lncRNA)
10.差异Peak基因GO和KEGG分析
高级分析
1.单位点修饰预测分析(SingleSite)
2.差异RNA修饰热图(Heatmap)
3.累计分布曲线分析(Cumulative Distribution Fraction Analysis)
4.关联分析(与RNA-seq 关联分析或多组学关联分析)
5.关联分析四象限图
6.关联分析热图(Heatmap)
7.IGV峰图(附5个基因)