浙江大学基因组科学（总第61期）研习班通知

办 学 历 史：18年（2003-2021）
开 班 时 间：2021年11月12日-19日（12日全天报到，13日期授课）
上 课 内 容：基因组学、蛋白质组学、系统生物学
上机实习内容：
1.基因组数据注释和功能分析； 2.转录组数据分析； 3.蛋白质结构与功能分析； 4.蛋白质组学数据分析； 5.系统生物学软件实习。

　　随着众多生物基因组测序项目的完成，生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据，已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。 我们将为您提供学术殿堂，请您参加我们举办的“基因组科学”研习班。
        本研习班创始于2003年10月，由DNA双螺旋结构的发现者詹姆斯·杜威·沃森教授与浙江大学沃森研究院首任院长杨焕明教授共同创办，2007年后由浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院继续承办，至今已成功举办59期。本研习班旨在通过基因组、蛋白质组、系统生物学等内容的系统讲授，为学员打开生物信息学的全新领域。
        这里您将可以听到于军教授（注：于军被《科学美国人》评为2002年度世界科学领袖）亲自主讲的基因组学基础知识和前沿进展。杨军、陈铭教授分别主讲系统生物学和蛋白质组学的研究方法和思路。我们也将为您邀请经验丰富的胡松年等教授给您细说基因转录组的测定及分析、新一代测序等实验技术的关键事项。如果您正在从事研究工作并想进一步提升科学研究水平，不妨来这里倾听浙江大学钟伯雄教授、徐建红教授分别述说在蛋白质组学和农学应用中的经验和体会。
         如果您想学习从互联网公共数据库获取数据、处理数据的方法，从中挖掘有价值的信息资源，您更应该来参加我们举办的“基因组科学”研习班。我们将为您提供优质服务，每人一台PC机，让您紧随大屏幕演示“跟我学”操作。上机实习课5次，带您进入基因组科学大门，辅导您运用网上的软件和工具，绘制进化树，探讨物种起源；从错综复杂的网络中，梳理分子间的相互作用。7天短暂的学习肯定会让您学有所获。我们还给您提供科学出版社发行的最新教材，便于自学、温故知新、复习巩固。
        本研习班四次荣获“浙江大学优秀项目创新奖”，一次入选“浙江大学国家级专业技术人员继续教育基地重点扶持项目”，已累计举办59期，学员遍布全国，累计培训学员5900余名。每期均不乏教授、博导参加培训，更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。他们中有一些带着课题或技术问题前来交流和联系，不少学员通过本研习班建立了长期协作关系，共同申请国家重大研究计划项目、国家自然科学基金等，共同发表论文，其中不少优秀的研究成果，已在SCI期刊上发表。

 一、培训班上课内容

　　上课内容涵盖“基因组学－>蛋白质组学－>系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。主要内容如下：
1. 基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展（讲课人：于 军 教授）
2. 基因转录组的测定及分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与精准医学（讲课人：胡松年教授）
3. 蛋白质组学和系统生物学应用及数据分析（讲课人：杨军、陈铭教授等）
4. 蛋白质组学概论及应用（讲课人：钟伯雄教授）
5. 基因组学在医学中的应用（讲课人：祁鸣教授）
6. 比较基因组学应用（讲课人：徐建红教授）
7.表观遗传学新技术及研究热点（讲课人：谷红仓 教授）

 二、培训班上机内容

　　上机实习课采用 “跟我学”方式，学习生物信息学软件使用，每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。主要内容如下：
实习一：基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具BLAST的学习，了解基因功能注释的原理；介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4，掌握系统发生树绘制的基本方法，认识基因复制在进化上的功能；学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习二：转录组数据分析
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理；通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示，了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法； 利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
实习三：蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始，接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析，预测目标蛋白的生物功能。
实习四：蛋白质组学数据分析
使用X！Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据，将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白；使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
实习五：系统生物学软件实习
利用Cytoscape系统生物学分析软件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子网络系统，并与基因表达等数据整合。

 三、培训对象

    从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生。

 五、教材

  “DNA和蛋白质序列数据分析工具”（第三版）， 薛庆中等编著，科学出版社出版 2012年6月发行。

  报到时由会务组提供。

 六、其他事项

培训地点：杭州 浙江大学紫金港校区
收费标准：注册费为￥4200/人（可转账，现金、刷卡【含公务卡】均可）。食宿费用自理，会务组可协助安排。
联 系 人： 沈志成 13958194424    咨询电话：0571-88206783
电邮地址:　 genetrain@zju.edu.cn 
 

   浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
2021年05月25日

附一：报名表

附二：邀请函

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