种属

基因数

探针数/ 每基因

数据来源

Homo sapiens 12x135K Array

人

44049

3

NCBI HG18, Build 36

Mus musculus 12x135K v2 Array

小鼠

44170

3

NCBI MM9

Rattus norvegicus 12x135K Array

大鼠

26419

5

Ensembl RGSC 3.4

物种

芯片格式

探针解析度

081229
HG18 Deluxe MeDIP HX1

Human

1 x 2.1M

18028 promoters: -7.3kp ~ +3.3kb;
28226 CpG islands;
475 miRNAs: -15kb through mature miRNA

090316
MM9 Deluxe MeDIP HX1

Mouse

1 x 2.1M

17354 promoters: -8.2kp ~ +3kb;
16002 CpG islands;
510 miRNAs: -20kb through mature miRNA

2006-11-02 HG18 CpG Promoter

Human

1 X 385K

覆盖转录起始位点上游 800bp至下游200bp，以及28226个CpG islands

2007-02-27 MM8 CpG Promoter

Mouse

1 X 385K

覆盖转录起始位点上游 1300bp至下游500bp，以及15963个CpG islands

080212 RN34
CpG Island Pro

Rat

1 X 385K

覆盖转录起始位点上游 1300bp至下游500bp，以及15809个CpG islands

HG18 RefSeq promoter

Human

1 X 385K

覆盖18028个基因启动子，转录起始位点上游 2.2kb至下游0.5kb

MM8 RefSeq promoter

Mouse

1 X 385K

覆盖17354个基因启动子，转录起始位点上游 2kb至下游0.5kb

RN34 RefSeq promoter

Rat

1 X 385K

覆盖15398个基因启动子，转录起始位点上游 2.25kb至下游0.5kb

芯片格式

探针长度

探针平均间距

基因组版本

描述

人

1×2.1M

60mer

1,169bp

hg18

全基因组

人

1×385K

60mer

7,073bp

hg18

全基因组

小鼠

1×385K

50-75mer

5,782bp

mm8

全基因组