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LncRNA:表观调控研究新视角

         表观遗传学(epigenetics)是新世纪以来分子生物学、遗传学及临床医学的研究热点,指的是基因组DNA未发生变化时可以引起基因表达改变的重要化学修饰。研究方向主要包括:DNA修饰(甲基化及羟甲基化)、组蛋白翻译后修饰(甲基化及乙酰化等)以及染色质重塑;这三个部分互相交叠共同调控着基因的表达。现有发现已表明,基因组特定位点的表观修饰变化不但影响相关基因表达,而且进一步影响生长、发育等生物学现象,并在多种疾病的发生发展过程中起到重要作用。而表观遗传通路(epigenetic pathway)调控着基因组表观修饰的动态平衡,该通路中关键基因的表达变化不但改变生物生长和发育,同时促进了包括癌症等重大疾病的起始和发展。
         lncRNA是一类新兴的表观遗传调控分子。近期大量的研究表明lncRNA不但可以通过调节组蛋白和DNA的化学修饰行使基因表达调控的功能;而且可以通过类似的机制调控表观遗传通路本身的基因,从而从根本上对基因组的表达进行深远的影响。LncPath™ Epigenetic Pathway LncRNA芯片(人,小鼠)专为建立lncRNA功能和表观遗传通路分子调控机制之间的联系而设计,全面收录了可能对表观遗传通路起表达调控作用的LncRNA。此款芯片可同时检测lncRNAs及其调控的表观遗传通路中的重要基因,比如 polycomb (PRC)和trithorax (TrxG) 染色质修饰分子,DNA和组蛋白的修饰酶EZH2(图1)以及通路的下游靶标等,帮助研究者快速而准确地发掘表观遗传深层次的lncRNA调控机制。

特色:
  • 表观遗传通路特异性蛋白编码基因的邻近LncRNAs
  • 表观遗传通路特异性蛋白编码基因的长链非编码ceRNAs (Competing endogenous RNAs)
  • 已知的与表观遗传通路相关的LncRNAs
  • 全面收录受LncRNA调控的表观遗传功能蛋白的编码基因
图1. 调控表观通路关键基因H3K27me3组蛋白甲基转移酶EZH2的lncRNA。
1. 调控表观通路关键基因H3K27me3组蛋白甲基转移酶EZH2的lncRNA。

其他
LncPath™ 通路/疾病聚焦的LncRNA芯片:

信号通路:
血管生成信号通路(Human, Mouse) 细胞凋亡信号通路(Human, Mouse)
Wnt 信号通路(Human, Mouse) 表观遗传信号通路(Human, Mouse)
Hedgehog 信号通路(Human, Mouse) Hippo信号通路(Human, Mouse)
代谢信号通路(Human, Mouse) 凋亡性坏死信号通路(Human, Mouse)
上皮间质转化(EMT)信号通路(Human, Mouse)
 
疾病:
癌症 (Human, Mouse)
心血管疾病(Human, Mouse)
神经退行性疾病(Human, Mouse)
 

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