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解析LncRNA在癌症信号通路中的分子调控功能
        上皮间质转化 (EMT, Epithelial-Mesenchymal Transition) 是指上皮细胞失去细胞连接和顶面-底侧细胞极性,转化为具有间质表型细胞的生物学过程。通过EMT,上皮细胞获得了细胞可塑性、迁移性、侵袭能力、干细胞样属性和抗凋亡等间质细胞表型特征。EMT在胚胎发育和伤口愈合等生理过程中发挥重要作用。尤为重要的是,EMT在癌症侵袭、转移和恶性进展等病理过程中起到关键作用。近来的研究表明长链非编码RNA (LncRNAs) 通过调控基因表达作用于EMT,为揭示EMT信号通路在癌症中的功能提供了新的研究方向。

        为了研究LncRNAs在EMT信号通路中的生物学功能,并将LncRNAs的调控机制与其在EMT过程中的生物学功能联系起来, 美国Arraystar公司推出了LncPath™ EMT Pathway LncRNA Microarray (Human, Mouse) 。该芯片全面收录了可以调控EMT信号通路的LncRNAs及其靶基因,并通过图形化展示LncRNAs与靶基因的调控关系(如图1)。利用该芯片可以同时检测与EMT相关的LncRNAs 以及靶基因的表达水平,能够快速、准确的分析两者间的表达关系,为LncRNAs在EMT过程中的功能和机制研究提供了依据。

EMT信号通路中LncRNAs及其靶基因的收集
  • EMT信号通路靶基因的邻近LncRNAs
  • 作为增强子型RNA (eRNA)调控EMT信号通路靶基因的LncRNAs
  • 作为内源竞争性RNA (ceRNA)调控EMT靶基因的LncRNAs
  • 来自权威文献,已知的与EMT相关的LncRNAs
  • 全面收集EMT过程中的编码基因作为LncRNA的靶基因,这些靶基因包括参与EMT过程的转录因子、调控因子、上皮细胞标志物、间质细胞标志物、细胞增殖、细胞迁移、细胞侵袭和细胞生存基因及参与EMT过程的多条信号通路。


图 1. 可能调控EMT过程中的关键基因TWIST1的LncRNAs详细信息

More LncPath™ Pathway/Disease Focused LncRNA Microarrays:

Pathways
Angiogenesis Pathway (Human, Mouse) Apoptosis Pathway (Human, Mouse)
Wnt Pathway (Human, Mouse) Epigenetic Pathway (Human, Mouse)
Hedgehog Pathway (Human, Mouse) Hippo Pathway (Human, Mouse)
Metabolism (Human, Mouse) Necroptosis Pathway (Human, Mouse)
Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) Pathway (Human, Mouse)
 
Diseases
Cancer (Human, Mouse)
Cardiovascular Disease (Human, Mouse)
Neurodegenerative Disease (Human, Mouse)
 

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