上皮间质转化 (EMT, Epithelial-Mesenchymal Transition) 是指上皮细胞失去细胞连接和顶面-底侧细胞极性,转化为具有间质表型细胞的生物学过程。通过EMT,上皮细胞获得了细胞可塑性、迁移性、侵袭能力、干细胞样属性和抗凋亡等间质细胞表型特征。EMT在胚胎发育和伤口愈合等生理过程中发挥重要作用。尤为重要的是,EMT在癌症侵袭、转移和恶性进展等病理过程中起到关键作用。近来的研究表明长链非编码RNA (LncRNAs) 通过调控基因表达作用于EMT,为揭示EMT信号通路在癌症中的功能提供了新的研究方向。
为了研究LncRNAs在EMT信号通路中的生物学功能,并将LncRNAs的调控机制与其在EMT过程中的生物学功能联系起来, 美国Arraystar公司推出了LncPath™ EMT Pathway LncRNA Microarray (Human, Mouse) 。该芯片全面收录了可以调控EMT信号通路的LncRNAs及其靶基因,并通过图形化展示LncRNAs与靶基因的调控关系(如图1)。利用该芯片可以同时检测与EMT相关的LncRNAs 以及靶基因的表达水平,能够快速、准确的分析两者间的表达关系,为LncRNAs在EMT过程中的功能和机制研究提供了依据。
EMT信号通路中LncRNAs及其靶基因的收集
- EMT信号通路靶基因的邻近LncRNAs
- 作为增强子型RNA (eRNA)调控EMT信号通路靶基因的LncRNAs
- 作为内源竞争性RNA (ceRNA)调控EMT靶基因的LncRNAs
- 来自权威文献,已知的与EMT相关的LncRNAs
- 全面收集EMT过程中的编码基因作为LncRNA的靶基因,这些靶基因包括参与EMT过程的转录因子、调控因子、上皮细胞标志物、间质细胞标志物、细胞增殖、细胞迁移、细胞侵袭和细胞生存基因及参与EMT过程的多条信号通路。
图 1. 可能调控EMT过程中的关键基因TWIST1的LncRNAs详细信息
More LncPath™ Pathway/Disease Focused LncRNA Microarrays:
Pathways: |
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Angiogenesis Pathway (Human, Mouse) |
Apoptosis Pathway (Human, Mouse) |
Wnt Pathway (Human, Mouse) |
Epigenetic Pathway (Human, Mouse) |
Hedgehog Pathway (Human, Mouse) |
Hippo Pathway (Human, Mouse) |
Metabolism (Human, Mouse) |
Necroptosis Pathway (Human, Mouse) |
Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) Pathway (Human, Mouse) |
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Diseases: |
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Cancer (Human, Mouse) |
Cardiovascular Disease (Human, Mouse) |
Neurodegenerative Disease (Human, Mouse) |
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