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Nature子刊:应用Exiqon miRNA qPCR Panel,探索胃癌血浆标志物
         南京医科大学肿瘤研究中心束永前教授、刘平教授、朱伟博士和周鑫博士,利用Exiqon microRNA Panel对胃癌病人血浆中的microRNA进行了系统的表达分析,发现了一组5个具有临床诊断潜能的胃癌血浆microRNA标记物(miR-185, miR-20a, miR-210, miR-25 and miR-92b)。该研究成果于2015年6月发表在Nature子刊Scientifc Reports杂志上(影响因子5.578)。(芯片实验由康成生物提供技术服务)

研究背景:
         胃癌在肿瘤发病率中排名第五,在癌症导致的死亡原因中排名第三。50%左右的胃癌发生在东亚,其中绝大部分发生在中国。确诊时,病人通常已经是中晚期,35%出现远距离转移,90%有淋巴结转移,并且预后差。目前针对胃癌的分子和临床特征的研究不断深入,临床筛查和治疗方法也有长足进步,但是,这些方法或者过于依赖检测者经验,或者价格太高无法推广,或者检测灵敏度和特异性还有待加强。因此,迫切需要开发新的可靠的非侵入型早期诊断标记物,促进早期干预和治疗,延长病人的生存期。

研究思路:
         研究主要分为三个部分:训练集,验证集和外部验证集。本研究共采用了242例胃癌病人和对照人群的血浆和组织样本,血浆中的microRNA高通量检测采用的是PCR芯片:Exiqon microRNA qPCR Panel(miRCURY-Ready-to-Use-PCR-Human-panel-I + II-V1.M)。围绕所发现的microRNA标记物,研究者进一步分析胃癌组织中对应的microRNA表达,比较外周血浆和动脉血浆中对应microRNA的表达,以及分析外周血浆分离的外泌体中的对应microRNA的表达,探索了血浆中microRNA的来源和在疾病发生发展中的作用。

         关于实验平台选择,考虑到血浆样本中的RNA含量低,研究者选择对微量样本检测灵敏度和线性范围更好的Exiqon microRNA qPCR panel: ”Compared to TaqMan platform that was used in the study of Zhu et al, we utilized Exiqon miRNA qPCR panels which appeared to show better sensitivity and linearity with measurements of miRNAs in relatively low abundance.”

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