总结了定位在细胞质和细胞核中的lncRNA的功能和作用机制。
细胞质中：lncRNA可通过与RNA互作或蛋白互作调控mRNA稳定性、调控翻译、调控翻译后修饰等。
细胞核中：lncRNA则更多的是作为表观遗传调控因子发挥作用。此部分，将从lncRNA在染色质结构中的作用、lncRNA在组蛋白修饰中的作用及lncRNA在DNA甲基化中的作用等几个角度进行总结。 |
分别总结了定位在细胞核和细胞质中的circRNA发挥的生物学功能。
细胞核内：circRNA可通过调控转录、调控可变剪切、调控调控染色质互作等发挥作用。
细胞质中：除了经典的circRNA作为miRNA吸附海绵（ceRNA机制）外，还可以通过与蛋白互作（作为蛋白海绵或蛋白支架等）发挥功能。最后，总结了circRNA-miRNA、circRNA-蛋白互作研究的技术方法。 |
lncRNA m6A：（1）“m6A转换器”的功能（2）影响lncRNA与蛋白互作或者与miRNA的结合；（3）m6A作为lncRNA降解的标志。
circRNA m6A：调控circRNA稳定性、促进非帽依赖的翻译、影响circRNA与蛋白互作、控制“自身的”和“外来的”circRNA免疫，也可能影响circRNA的ceRNA机制。
miRNA表观转录组学：（1）miRNA上的各类修饰与miRNA生成；（2）成熟miRNA上的修饰及其生物学功能。
单碱基m6A位点的意义：总结了单碱基m6A位点的功能意义。 |
miRNA最常被提到的作用机制是通过RISC复合体靶向降解mRNA，同时其他的lncRNA、circRNA分子也可以通过竞争性结合miRNA，发挥ceRNA机制。此部分则通过多个不同的案例总结了miRNA的非经典功能。 |
tsRNA，即tRNA来源的小RNA，包括tRF&tiRNA。这一类新兴的非编码小RNA在压力应激、信号传导和基因表达调控等过程中发挥重要作用。此部分重点介绍的tsRNA作用机制包括转录本衔接模型与转录本替代模型，并介绍了进行tsRNA与RNA或蛋白互作研究的技术手段。 |
tRNA即转运RNA，除了被动地参与蛋白翻译，也是一类重要的基因调控因子。此部分总结了tRNA表达的组织特异性、不同增殖或分化状态下tRNA库的不同及tRNA表达与疾病的关系。另外，此部分也重点介绍了密码子最优性与翻译效率及mRNA修饰之间的联系。 |
