基因组研究之SNP分析

 

       SNP(单核苷酸多态性)是指在基因组上单个核苷酸的变异。SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C 常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于1 %的单核苷酸变异,主要用于高危群体的发现、疾病相关基因的鉴定、药物的设计和测试以及生物学的基础研究等。目前,SNP作为第三代遗传标志,已经成为人类基因组计划走向应用的重要步骤。欧易技术平台提供多种SNP检测技术服务,满足您不同方面的研究需要。您只需要提供保存完好的组织(包括石蜡包埋的组织)、细胞、血液、血浆或血清等标本,我们可以针对您提供的SNP检测实验,最终提供给您完整规范的实验报告,为您节省大量的时间和精力。

直接测序法检测SNP
Taqman探针法检测SNP
illumina goldengate SNP芯片

直接测序法检测SNP
       适合少量样本、未知SNP位点的研究。在所有SNP的检测方法中,对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法,也是SNP分析的金标准。

Taqman探针法检测SNP
       适合大量样本的特定或较少SNP位点检测。操作简便,只需一步 PCR 反应,无须进行纯化和预处理。
技术特点

  • 适合位点数量少,样本通量高的检测(每个位点需要合成两条探针,探针合成费用高)
  • 应用ABI7900、ABI7500定量PCR仪进行定量检测
  • 操作简便,只需一步 PCR 反应,无须进行纯化和预处理,直接上机检测
  • 结果清晰,软件分析结果界面友好,标出了每个样本的基因型及荧光强度,非常直观
  • 可采用ABI合成的探针或国产探针

Illumina Goldengate SNP
       利用illumina公司独有的微珠芯片专利技术,高检出率,高成功率,高准确率,为目前最佳中高通量SNP分析解决方案,极高的性价比。平均下来单个反应费用低。格式为96位点/芯片,384位点/芯片,768位点/芯片,1536位点/芯片。建议芯片订货数量为96的倍数。

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