microRNA(microRNA)是一种小的内源性非编码RNA分子，大约由21-25个核苷酸组成。通过与靶基因的3’UTR配对，促进mRNA的降解或抑制mRNA的翻译，从而抑制靶基因的表达。
现在，miRBase共收录223个物种的28645个microRNA前体，35828个成熟microRNA (miRBase, v21, 2014年6月)。
大鼠、小鼠及人类基因组中成熟microRNA数目 |
一、上海伯豪Agilent microRNA芯片服务
上海伯豪作为安捷伦科技有限公司（Agilent Technologies Inc.）在中国的首家技术服务供应商（Certified Service Provider, CSP）已获得四个年度的Agilent最佳服务供应商奖（Best Certified Service Provider, BCSP），在Agilent miRNA芯片服务领域，已经进行了11812份样品的miRNA芯片检测服务，协助客户发表SCI论文70余篇，影响因子300余分。
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Agilent 中国第一家认证服务商 |
历年Agilent最佳服务供应商奖 |
上海伯豪质量控制体系：
- 质量标准严格：QA系统为您的实验全程护航，实验严格按照153个SOP文件进行。
- 实验记录完备：工厂化的流水线作业项目流程，保证所有实验记录可供回溯。
- 多重实验质控：实验室QC、数据分析QC、项目QC—3重QC，减少低质量数据。
二、Agilent microRNA芯片介绍
安捷伦公司作为国际领先的生物芯片制造企业，利用其先进SurePrint Inkjet芯片生产工艺，开发出具有独特设计的microRNA检测芯片，能特异性地检测出成熟的microRNA并能很好地区分高度同源的microRNA分子。该平台还具有特异性高、灵敏度高等特点。可以广泛地应用于检测和比较各类样品的microRNA表达状态，并通过分析其调控的靶基因来深入分析其调控机制或生物学功能。
Agilent microRNA芯片探针设计图
Agilent microRNA芯片技术特点：
- 唯一能通过特殊的探针设计区分成熟microRNA和microRNA前体的芯片平台；
- 无需分离microRNA，直接用Total RNA 进行实验，只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验（不包括质检所消耗的量），避免了分离、富集、放大等过程带来的影响；
- 样品适用范围广：组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验；
- 高特异性：特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异；
- 高灵敏度：检测丰度跨4个log，最高可达6个log，只要存在6000个拷贝的分子就可以检出；
- 数据来源于miRBase 数据库，并方便及时更新。
四、实验流程
五、数据分析路线
六、数据分析内容
- 基础分析内容：原始数据归一化处理 、Box Plot图、PCA图、聚类图、基因水平表达差异筛选、散点图、火山图、miRNA靶基因预测。
- 高级分析内容：GO富集分析、KEGG富集分析、miRNA与靶基因网络图、miRNA－GONetwork 、miRNA－Pathway Network、miRNA的转录因子的预测 、miRNA与表达谱芯片平台的联合分析。
七、数据分析展示
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质控相关—Box Plot图 |
质控相关—聚类图 |
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质控相关—PCA图 |
质控相关—样品相关性系数图 |
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差异基因结果图形展示—散点图 |
差异基因结果图形展示—火山图 |
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差异基因结果图形展示—聚类热图 |
microRNA靶基因预测 |
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microRNA与靶基因网络图 |
GO 富集分析及miR-GO Network |
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microRNA－Pathway Network |
microRNA与表达谱芯片平台的联合分析 |
八、上海伯豪客户发表经典应用案例
* 揭示宿主细胞限制HIV-1复制的新机制
* 基因芯片筛选发现大肠癌早期诊断分子标志物
* 基因芯片筛选发现乙型肝癌血清血浆microRNA生物标志物
* microRNA芯片筛选发现血清血浆中的胃癌早期诊断标志物
* miR-95通过抑制SNX1基因增加结肠癌细胞的增殖速度
* microRNA芯片与表达谱芯片的联合应用
* 激光捕获与Micorarray的联合应用—提高检验组织样品的特异性
>> 更多经典案例请参见：Agilent miRNA芯片服务文献 |
