伯豪生物circRNA芯片—带您畅游“隐秘而未知的RNA平行宇宙”—环状RNA的海洋
促销时间：2016年8月29日- 2016年9月29日
产品介绍：
环状RNA（Circular RNA，circRNA），是一大类具有闭合环状结构的特殊非编码RNA。环状RNA大量存在于真核细胞中，通常具有组织或发育阶段的表达特异性，且多数序列高度保守，是扮演重要调控作用的新明星分子。
circRNA在功能上可作为miRNA的海绵吸附体，以ceRNA的机制调控基因；与RNA结合蛋白相互作用而调控其他RNA、编码蛋白等功能。此外，circRNA由于呈闭合环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。这使得环状RNA在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明显优势。
circRNA芯片特点：
- 利用芯片碱基互补杂交的方式，能够对整体表达丰度较低的circRNA更灵敏、稳定地进行检测。
- circRNA所有探针设计基于最新最全的国际主流circRNA数据库信息，芯片探针几乎完全覆盖circbase。
- 环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，避免与母基因之间的冗余影响
芯片参数：
- 环状RNA数目：88371
- 数据库来源: Circbase
- 探针长度：60 nt
- 探针策略：特异覆盖反向剪接位点
circRNA研究技术线路：
数据分析流程：
疾病相关环状RNA预测：
通过环状RNA及与疾病相关microRNA交互作用分析，并整合已发表GWAS数据预测与疾病相关的环状RNA。
ceRNA调控分析（需要mRNA表达信息）:
基于基因的表达值，通过回归模型分析以及种子序列匹配的方法，建立microRNA的海绵吸附作用的调控网络，找到核心的ceRNA。
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