首页 > 核心刊物 > 中国科学:生命科学 2018.6 Vol 48, No.6 > 栖息于青藏高原不同海拔环境的两种草原毛虫 miRNA转录组的比较分析

栖息于青藏高原不同海拔环境的两种草原毛虫 miRNA转录组的比较分析

杨兴卓, 张棋麟, 李敏, 贾程琳, 周敏强, 袁明龙

1. 兰州大学草地农业科技学院, 草地农业生态系统国家重点实验室, 兰州730020 2. 兰州大学, 农业部草牧业创新重点实验室, 兰州730020 3. 草业科学国家级实验教学示范中心(兰州大学), 兰州730020 4. 南京大学生命科学学院, 演化发育生物学研究所, 南京210023

 
Key Words: 毒蛾亚科, 小RNA, 基因表达, 青藏高原, 高海拔适应
 

Abstract

有关动物适应异质性海拔环境的研究, 已在表型、解剖学、生理学、基因组学和转录组学等方面广泛开展, 但是很少关注小RNA (microRNAs或miRNAs)的生态适应性功能. 草原毛虫是青藏高原高寒草地的重要害虫,并对不同海拔环境产生了良好的适应性. 为此, 本研究以两种栖息于青藏高原不同海拔环境的黄斑草原毛虫和门源草原毛虫为研究对象, 基于Illumina HiSeq技术对这两种草原毛虫的miRNA转录组进行了高通量测序. 结果表明, 两种草原毛虫中共鉴定到109个成熟miRNAs, 其中47个为保守miRNAs. 在所有miRNAs种, 共有9个miRNAs的表达水平在两种草原毛虫间存在显著差异性. 对这9个差异性表达的miRNAs采用实时荧光定量PCR进行验证, 发现8个基因的表达水平与高通量测序结果完全一致. 功能分析表明, 差异性表达的miRNAs共预测到93个靶基因.这些靶基因主要富集到脂、核酸和维生素等代谢或衰老相关的GO条目, 并与代谢、抗寒和低氧等KEGG通路相关(如AMPK信号通路、Wnt信号通路和mTOR信号通路). 这些研究表明, miRNAs在草原毛虫对异质性海拔环境的适应性进化过程中具有重要作用. 该研究加深了对青藏高原特有昆虫适应高海拔环境的遗传基础的理解.


 


期刊简介
 
主管:中国科学院
编辑:《中国科学》编辑委员会
主编:王大成
国内刊号:CN11-5840/Q
国际刊号:ISSN1674-7232
邮发代号:国内:80-204 国外:BM40C