Gene News                                                基因快讯2005年第1期

全基因组扩增试剂盒——QIAGEN REPLI-g Ki

QIAGEN公司推出的REPLI-g Kit可以从少量样本中稳定扩增全基因组DNA。REPLI-g Kit包括分离和扩增DNA的试剂,适用的样本广泛,包括已纯化的基因组DNA、全血、组织培养细胞、显微切割得到的细胞、速冻的组织切片、血浆血清中的细胞、口腔细胞、血斑。

一、REPLI-g Kit的应用:

1. 用来从全血和组织培养细胞中直接分离扩增全基因组DNA

研究人类疾病的时候,我们无法大量采集病人的血液或者仅仅只能获得极少量血样,导致DNA样本量不足,为基因分型和DNA序列分析的研究带来极大不便。REPLI-g Kit可以从0.5ul血液或者0.5ul细胞悬液(大于600个细胞/ul)中扩增得到40ug基因组DNA,使得研究者可以不用再为样本少而发愁。

2. 扩增已经纯化的基因组DNA。

不少研究机构保存了大量年代久远的珍贵DNA样本,而随着时间推移,这些样本出现原因不明的质量下降,无法很好的应用于下游DNA序列分析。使用REPLI-g扩增这些样本,使这些陈旧的DNA样本重获新生。

二、REPLI-g Kit的原理

REPLI-g试剂盒采用的多重置换扩增(MDA)技术,能对基因组DNA进行稳定的扩增。首先随机六碱基引物在多个位点与模板DNA退火,接下来Phi 29 DNA 聚合酶在DNA的多个位点同时起始复制,它沿着DNA模板合成DNA,同时取代模板的互补链。被置换的互补链又成为新的模板来进行扩增,因此最终我们可以获得大量高分子量的DNA。REPLI-g试剂盒中使用独特的Phi 29 DNA聚合酶,该酶对于模板有很强的模板结合能力,能连续扩增100Kb的DNA模板而不从模板上解离。同时这种酶具有3’—5’外切酶活性,可以保证扩增的高保真性。

图-1 MDA原理示意图

 

 三、 REPLI-g Kit的特点

1. 扩增产量稳定

REPLI-g试剂盒的反应体系是50ul,每次反应的标准产量是40ug左右,不论加入的模板量多少,产量都是十分稳定的(图2)。因为每次反应的产量基本相同,在反应结束后无需再进行DNA的定量就可以直接进行下游实验,因此非常适合于高通量实验。

图2恒定的产量
----不同的起始模版量均可得到高达40ug的DNA

2. 扩增产物长度有保障

产物的长度在2Kb-100Kb之间,平均长度大于10Kb,扩增获得的DNA适合用于各种限制性酶分析和长距离PCR反应
(图3)

图3得到高分子量的基因组DNA ---- 平均长度大于10Kb

3. 无位点扩增误差

与传统的方法相比较,REPLI-G试剂盒不但省时省力,同时,由于它对整个基因组进行的是非常均匀的扩增,所以各个位点的扩增偏差很小,确保了下游实验的准确性
(图4)。

 

 

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