蛋白质组学和蛋白质分析

    胰蛋白酶酶解的磷酸化肽

   磷酸化肽的MS/MS谱图(pYLpYEIAR):
    a) 双质子的未修饰的肽段的MS/MS谱图。
    b) 带单电荷经磺酸硫氨酯修饰的肽段的MS/MS谱图。

非胰蛋白酶酶解肽段



C端无基本氨基酸的肽段的MS/MS谱图(YKELGFQG):
    a) 双质子的未修饰的肽段的MS/MS谱图。
    b)带 单电荷的磺酸硫氨酯修饰的肽段的MS/MS谱图。C端无赖氨酸或精氨酸的肽段不易获得易解析的碎片模式,然而如果该肽段在近N端或C端带有碱性氨基酸,那再进行磺酸硫氨酯修饰就可能有效果。

 

MALDI的比较

      带单电荷的磺酸硫氨酯修饰的肽段的ESI-MS/MS谱图与MALDI-PSD谱图的比较(相应的母片段未显示)。ESI能获取更高效的碎片但大体的MS/MS谱图趋势在MALDIESI上均接近。

样品模型
    带单电荷的磺酸硫氨酯修饰的肽段的MS/MS谱图采用下述的模型:

  •  碎片离子的强度随着断裂位点与N端之间的距离的增加而减弱。

  •  脯氨酸的存在可起强烈抑制脯氨酸与肽段C端之间的断裂。

  •  断裂受断裂位点邻近氨基酸的影响如下图所示。

 
A
C
D
E
F
G
H
I
K
L
M
N
P
Q
R
S
T
V
W
Y
N
1
0.42
0.37
0.58
1
0.14
1
1
1
1.3
1
0.14
1
0.55
1
0.24
0.44
1
1
0.4
C
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
4.7
1
1.8
1
1
1
1
1
1
1

     模拟的带单电荷的磺酸硫氨酯修饰的肽段MS/MS谱图举例。测得的谱图用红色表示(相应的母片段未显示),模拟谱图用黑色表示(相应的母离子强度未模拟)。
结 论
    用磺酸硫氨酯对肽段进行修饰简化了电喷雾离子化碎片的谱图,提高了获得信息的质量,使谱图解析及测序更容易。
参考文献
T. Keough et al., Analytical Chemistry 75 (2003) 157A.
M. Bauer et al., Rapid Commun. Mass Spec., 12 (2000) 924

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