芯片技术帮助肺癌研究新突破

【字体: 时间:2001年11月28日 来源:

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   斯坦福大学医学中心的研究人员发现了一组可以区分不同形式肺癌的基因。这项发现有助于医生提前确定治疗策略,还可能导致 将来出现治疗肺癌更好的药物。

 “这意味着我们可以区分不同类型的肺癌,而这在以前是不可能的。这些差异导致不同的临床后果。”该研究的高级研究员、遗传学教授David Botstein 博士说。研究结果发表在11月13日的《美国国家科学院学报》上。

  当前医生可以将肺癌肿瘤区分为4种类型:小细胞、扁平细胞、大细胞和腺癌。对于小细胞肿瘤,医生们可以相当准确地诊断预后。但其他3种类型的肿瘤,尤其是腺癌,对标准治疗方法 的反应差异很大。

 “肺部腺癌在形态上可能相似,但病人的幸存机会和对药物的敏感性却不尽相同。”文章的第一作者、Mitchell Garber 博士后指出。“目前,病理学家还不能确定诊断为腺癌病人的幸存几率。”

   Garber认为这些差异可能是由肿瘤内的基因变化引起的。如果事实果真如此,医生就需要另外的工具来查明肿瘤如何发育以确定不同病人的最佳 治疗方案。“短期目标是了解不良预后的肿瘤的指纹标记,”Garber认为,“这将鼓励临床医师更仔细的检查病人体内其他的肿瘤。”

   为查明肺癌肿瘤之间到底是否存在基因表达差异,Garber从67个肺癌肿瘤样品和6个正常肺部样品中提取RNA并进行标记——RNA是由活跃的基因产生的,可用于鉴别已知样品中哪些基因被表达。随后,Garber这些标记好的RNA探针和Affymetrix公司的固定有17,108个人类基因的基因芯片 进行杂交。如果样品中含有与芯片上的基因对应的RNA,RNA就会结合到该点上,产生可视信号。信号越强,表明RNA含量越多,就意味着基因表达更活跃。应用这一技术,Garber根据 基因表达模式将样品分类。

  大多数情况下,通过光学显微镜分成一类的样品在这种遗传分类上通常也是属于同一类。然而腺癌样品,却被划分到3组不同的亚型中。携带这些亚型的病人病况不同,因而了解 病人属于哪个亚型可为医生提供有关癌症将如何发展的有用信息。在过去的5年中,肿瘤亚型1病人的幸存率为40%,而亚型3病人却无一幸存。到该研究结束为止,所有亚型2病人均仍然幸存。

  Garber表示,起初,将亚型1和亚型3肿瘤诊断为肺癌的不同阶段表现。亚型3病人体内的晚期肿瘤比亚型1的要多,而两组病人的幸存率却是一样的。然而,亚型2病人体内的晚期肿瘤和早期肿瘤数量 介于亚型1和3之间。不经过遗传分析,医生无法区分这些相似的亚型病人,也无法预测病人幸存的机会。

   Botstein认为这种区分肺癌肿瘤的方法可以帮助医生确定疗法,“对于那些处于较轻亚型病症的幸运儿,医生可以考虑毒性小得多的疗法。”他说。

   他还指出腺癌占所有肺部肿瘤的30%,它们占这次研究样品中的56%。他预言一次规模更大、更具代表性的实验将揭开其它类型肿瘤中的遗传亚型。

   除了预测肿瘤的严重程度,未来的药物试验还可以检验药物对不同遗传亚型肿瘤的效用。“一种疗法对一种亚型有效,但未必同样适用于其他亚型。”Botstein说:“人们将很快看到这种方法的应用。”

   斯坦福大学医学中心是一个集科研、医学教育和病人看护于一体的综合机构,包括斯坦福大学医学院、斯坦福医院和诊所、Lucile Packard儿童医院3个部分。欲知更多信息,请访问:

http://mednews.stanford.edu

生物通摘译

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