Syngenta结束了水稻基因组测序,而国际联盟正在继续

【字体: 时间:2001年02月06日 来源:

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【生物通编译】

瑞士一家农业化学品公司已经完成了第一个重要粮食作物——水稻的基因组测序。但是需要该数据的科学家们将或者必须支付使用该序列数据的费用,或者要再等三年,直到一个国际合作组完成其同一个项目的使用公共资金完成的——并且可能更为完全的——版本。

上周,瑞士巴塞尔的Syngenta AG,宣布完成了水稻基因组43000万碱基对中大部分的测序工作。该工作在该公司加州的科学家的监督下完成,并且主要由盐湖城的Myriad Genetics Inc.完成。该项目耗时14个月,比预期提前了6个月,并且耗资在预算范围内,尽管该公司没有透露总耗资。结果他们超过了由日本领头的,预期在2004年耗资10000万美元完成的国际水稻基因组测序计划的工作进程。

国际合作组成员之一,纽约冷泉港实验室的Rob Martienssen说:“在技术水平,他们应该是非常自豪的,他们的测序覆盖面非常好,而且确实完成了大量的测序,但是离完全序列还差得很远。”

Syngenta的计划对每个核苷酸平均进行六次测序。然而,为了确保完成完全的连续性的没有缺口的序列测序,每个核苷酸需要被测序10或12次。

在去年12月份,植物遗传学家们宣布第一个高等植物Arabidopsis thaliana的全基因组序列完成。Arabidopsis thaliana是一个用来进行基础植物研究的模型生物,但是没有商业价值。相反,Syngenta的遗传学研究分支,Torrey Mesa研究所所长Steven Briggs说,了解水稻基因组可以让科学家们不仅改善水稻品种,而且找到在相关经济作物,如小麦和大麦中表达的类似基因。

Briggs说,Syngenta水稻图谱将“不会被放在公共领域。”然而,Syngenta将通过科学合作为学术研究者们提供获得该数据的权利,作为回报,该公司将分享由这些研究带来的任何商业发明。Syngenta还说将为发展中世界提供信息和技术以提高这些国家的仅够维持的农业。但是Martienssen说Syngenta工作的价值,由于其相对不可获得性,而遭到了损害。“如果这不是一个真正的公众通用资源,并且如果不能被搜索,这项工作就不会有相同的影响。”

Syngenta曾经与公共水稻合作组进行过合作,资助测序用来作测序最初模板的细菌人工染色体的末端。而且这不是唯一的商业参与者。去年四月,孟山都公司完成了自己的覆盖率为4倍的水稻基因组草图,并且允许国际项目使用自己的数据。

国际项目通过使用孟山都公司的数据,将自己预期的项目完成年限提前了4年。领导12个染色体之一的1号染色体计划项目的日本的科学家们计划在今年三月宣布他们的结果。日本水稻基因组研究计划的负责人Takuji Sasaki希望找到加速测序的途径,但是他说:“那将需要额外的资金。”Martienssen补充说:“我们不能仅仅为了加快速度而牺牲精确性或完全性。”

——摘译自Science Volume 291, Number 5505, Issue of 2 Feb 2001, p. 807

(未经允许,不得转摘)

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