人类基因组问题新发现

　　

生物通编译：细菌并不象我们曾想象的那样自由轻松地支配它们的基因。研究者们说，基因并不是直 接从细菌到达人类，而是来自共同的祖先。他们获得的证据现在正在建立一个进化树，并且减少了我们对 于遗传修饰生物的恐惧^1,2。

人类基因组序列带给人们不少真正的惊奇。公共测序联盟宣称至少113个基因可能是从细菌“水平迁移 ”进入人类基因组中的，从而引起不小的轰动³。

但是这种基因插入的说法令进化生物学家表示怀疑。现在美国的两个研究组已经获得了证据驳斥这种 说法。

起源分析假设人类和细菌共有的基因，但是非脊椎动物，如果蝇，酵母，线虫和拟南芥中没有的基因 ，是水平基因迁移的那些基因。

但是马里兰州的基因组研究所的Jonathan Eisen指出，其它生物可能本来也具有这些基因，但是之后丢失了这些基因。他说：“这在进化过程中是常见现象。”

为了支持这个理论，Eisen和他的同事们重新分析了序列数据，增加了进行比较的物种数量¹。在许多情况下，在非脊椎动物中发现了类似的基因，如寄生虫，海绵和真菌，驳斥了基因直接水平从细菌迁移到脊椎动物的观点。

但是Eisen说，建立是否发生水平基因迁移的标准是绘制进化树来追踪基因的继承者。

现在出版的这些进化树已经确定了事实。曾认为是水平迁移基因中的28个基因的进化树揭示几乎所有的基因也在其它远亲缘关系的祖先中存在。正如宾夕法尼亚的GlaxoSmithKline公司的Michael Stanhope和同事们所预测的一样²。

Stanhope解释说：“我们的研究寻求更彻底的序列表述。”——从霉菌到蚊子。他说，一个基因存在于人类可以因此被解释为来自共同的祖先。

细菌经常交换基因，包括那些抗生素耐药基因，甚至在较远关系的物种之间进行交换。但是从细菌到脊椎动物或其它多细胞生物的水平迁移则非常罕见。

这样的基因跳越可能发生在细菌进入卵细胞或精细胞中，而且基因可能需要整合进入基因组中从而传递给后代。Stanhope说：“这是相当少见的情况，”——因此发生113次似乎是无法实现的。

该研究组希望能够解除公众对转基因生物的基因水平迁移到人类的恐惧。（版权所有 转载请注明）

1. Salzberg, S.L., White, O., Peterson, AJ. & Eisen, J.A.Micorobila genes in the human genome: lateral transfer or gene loss?. Science, 292, 1903 - 1906, (2001).
2. Stanhope, M.J. et al.Phylogenetic analyses do not support horizontal gene transfers from bacteria to vertebrates.. Nature, 411, 940 - 944, (2001).
3. International Human Genome Sequencing Consortium.Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature, 409, 860 - 921, (2001).

——摘译自6月21日（heartlake）