[AD340X300]我国在世界基因组领域的领先地位再次得到确认：我国科学家绘制出基于精确DNA 测序和基因组物理图谱的水稻（籼稻）基因组“精细图”，这是全世界第一张农作物的基因组精细图谱，也是一项令世界瞩目的科学研究成果，它为阐明水稻基本生物学性状的遗传基础，识别、筛选具有经济价值的遗传基因打下了坚实基础。
   
    国家自然科学基金委副主任朱作言１２日代表中科院、科技部、国家计委和国家自然科学基金委发布了上述消息。在中科院基因组信息学中心暨北京华大基因研究中心、杭州华大基因研究发展中心等单位绘制的这张水稻基因组“精细图”上，确定了基因在染色体上的分布和定位，以及可用于分子育种的遗传标记。
   
    中科院基因组信息学中心暨北京华大基因研究中心副主任于军说，籼稻和以籼稻为遗传背景的杂交稻占世界水稻生产的８０％，在“框架图”的基础上绘制完成的水稻基因组“精细图”，将为全球从事水稻和植物生物学研究的科学家提供急需的数据，为功能基因组学和蛋白质组学的研究奠定坚实基础，将为全面阐明水稻的生长、发育、抗病、抗逆和高产规律，推动遗传育种研究产生重大影响。
   
    朱作言说，我国科学家完成的水稻的基因组“精细图”，覆盖了９７％的基因序列，其中９７％的基因被精确地定位在染色体上；覆盖基因组９４％染色体定位序列的单碱基准确性达到了９９. ９９％。这张图已达到国际公认的基因精细图标准，它也是迄今为止唯一的基于“全基因组鸟枪法测序”构建的大型植物基因组高精度基因图。“精细图”绘制了水稻亚种内和亚种间分子遗传标记图谱，这些标记可以用来鉴别基因的起源和进化，追踪它们在遗传群体中和杂交过程中的分布，进而指导遗传育种实践。
   
    我国科学家还预测出约６万个水稻基因，利用这些信息制备出了全基因组基因芯片，为功能基因组研究提供了强有力的工具，为大规模分离抗病、高产、优质的相关基因奠定了基础。
   
    新闻背景
   
    水稻基因组“框架图”与“精细图”有何区别？
   
    ２００１年１０月，中科院、科技部和国家计委联合向全世界宣布，中国率先完成水稻（籼稻）基因组工作“框架图”的绘制，得到高度评价，而现在我国科学家又在世界上首次绘制完成水稻基因组“精细图”，同样引起世界高度关注。那么“框架图”与“精细图”有何区别？
   
    中科院基因组信息学中心暨北京华大基因研究中心副主任于军说，“框架图”是相对于“完成图”或“终图”而言的，但实际上，真正的“完成图”并不存在，因为它总会存在一些空隙，而“精细图”则比“框架图”更进一步，更为准确、精细。
   
    基因组工作“框架图”的要点包括：测序工作量达水稻基因组的５倍；基因组覆盖率达９０％以上，即经初步组装的“一致性”序列占整个基因组的９０％以上；经初步组装的“一致性”序列中碱基的准确率达９９％以上，即每一碱基出错的可能性（误差率）应低于１％。
   
    水稻基因组“精细图”则提高了全基因组覆盖率，实现了基因在染色体上的分布和定位，并提供了大量的基因多态性位点，为分子育种研究的遗传标记奠定了分子生物学基础，对基因预测、基因功能鉴定的准确性以及基因表达、遗传育种等研究的贡献是一个质的飞跃。我国科学家在世界上首次完成的水稻基因组“精细图”，覆盖率达９７％，其中９７％的基因精确定位在染色体上；覆盖基因组９４％染色体定位序列的单碱基准确率为９９. ９９％，已达到国际公认的基因组“精细图”的标准。
   
    什么是“全基因组鸟枪法测序”？
   
    我国科学家在世界上首次绘制出的水稻基因组“精细图”，采用的是“全基因组鸟枪法测序”，这种方法引起人们的关注，究竟何为“全基因组鸟枪法测序”？
   
    中科院基因组信息学中心暨北京华大基因研究中心副主任于军介绍，“全基因组鸟枪法测序”也称“霰弹法”，是将基因组ＤＮＡ打成小片段进行测序，然后再将这些小的片段拼接起来，重新组装成一个完整的基因组。它的最大优点是经济、快速、高效，但对高性能计算的方法和设备要求非常高。
   
    运用“全基因组鸟枪法测序”组装成高精度全基因组的基因图，是一项技术上的新突破，在基因组研究中属首创。植物基因组有大量的重复序列，重复序列的正确识别和组装，需要开发特殊的计算软件，我国所建立的全基因组鸟枪法测序基因组组装的计算软件体系，也为开展其它重要物种的基因组研究开辟了一条全新的经济、快捷和可靠的研究方法。（新华社记者 张景勇）
   
    来源：新华社 (http://www.ebiotrade.com/)