ENCODE:人类基因组学进入第二轮

【字体: 时间:2003年03月11日 来源:

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    [生物通讯]随着下个月人类基因组的最后一个碱基被定位,一个熟悉的声音再度想起:下一步做什么?3月7日,美国国家人类基因组研究院(National Human Genome Research Institute ,NHGRI)的代表们在于总部举行的一次专家云集、非比寻常的研讨会上探讨了这个问题的答案。

    二月末,NHGRI发布力加入他们最新的基因组计划--DNA元件百科全书(Encyclopedia of DNA Elements)或ENCODE的号召。由于人类基因组序列中的30亿个字母都已被拼写出来,下一个目标就是定位或识别其中有意义的部分。这包括确定哪些DNA编码蛋白,哪些不编码蛋白,以及查明调节基因表达的元件。

    NHGRI采取了一个非常规的邀请感情趣的申请者来提出问题和解答问题的步骤,来帮助制定ENCODE的细节。NHGRI已拨出至少3600万元用于未来3年的ENCODE计划,其中的大部分将被分发到5到15个研究小组,共同负责识别出1%人类基因组中的功能元件。这一步完成后,研究小组将比较序列的注释,以确定哪些技术被证明效率最高,最准确。然后NHGRI就会扩大计划,注释其余99%的基因组。

    NHGRI的官员承认,协调ENCODE及其产生的大量基因组信息是令人生畏的艰巨任务。而且,质量标准现在也没有确定--虽然该计划需要这些数据迅速公布到公共网站上。

    尽管关于资金如何分配以及ENCODE计划如何进行还有许多问题未解决,但与会者对于该计划都感到无比兴奋,他们说,这是挖掘人类基因组宝藏的第一良机。“毫不夸张地说,我认为这是一件意义特别重大的事。”波士顿Dana-Farber癌症研究所的John Stamatoyannopoulos说。Stamatoyannopoulos正在考虑申请一份ENCODE资金。“这个计划可能要花上10个亿,比人类基因组计划的资金多得多。”(生物通编译,未经授权,请勿转载)

 

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