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[生物通讯]利用人类基因组计划开发出来的强大DNA测序工具，科学家已经测序了数百种早先未知细菌的部分或全部基因组。这项新研究彰显了海洋丰富的细菌多样性，将有助于揭示细菌在控制全球环境中所扮演的关键角色。

要了解一个生态系统是如何运行的，生态学家必需首先识别出栖息于其中的生物。这对于细菌生态学家而言是个难题，因为地球上只有约1％的细菌曾在实验室培养过。研究人员通过识别遗传标记特征已经确定了未曾实验室培养的细菌物种，但这些遗传标记特征信息并未揭示多少细菌的生活方式方面的信息，例如它们燃烧哪些化学物质作为能量，以及一个物种如何生活在另一物种排放的废物之中。

为更多地了解大洋区细菌的生活方式，著名基因组学科学家、马里兰州生物能量替代研究所的J. Craig Venter和他的同事从马尾藻海一片位于北大西洋西印度群岛与亚速尔之间的部分海域收集了水样。在对水样进行过滤只保留细菌或古菌后，研究小组提取样本的DNA。接下来他们将DNA破碎为更小的片段，测序10.5亿个碱基对，然后用计算机模型重建不同物种的部分基因组。这项研究发表在3月4日期的《科学》杂志的网络版上，共发现148个全新细菌物种和120万个新基因，几乎是所有早先研究发现的新基因的10倍。

同时，加州大学伯克利分校的Jill Banfield和他的同事用类似的测序方法也测序了加州一个废弃金矿的高酸性地下水中的细菌基因组。他们重建了两种细菌的基因组，并部分重建了另外三种细菌的基因组，这5种细菌就像一张粉红色的生物膜一样共同生活在一起。根据发表在3月4日期《自然》杂志上的研究结果，其中一种细菌的近源种从未被测序过，研究人员推断出其大部分代谢通路，并查明她是如何以铁为食的。

这两项研究为破译其它环境中的细菌的基因组、揭示细菌如何改变全球的炭循环和氮循环、细菌带血是如何进化的、种类如此之多的细菌是如何共存的等等这些问题开辟了道路，新泽西州Rutgers大学的海洋生物学家Paul Falkowski说。“这仅仅是个开始。”（生物通编译）