用于引导转录起始位点附近的基因组DNA序列的PNA/RNA，能有效降低目标基因的表达，据此而开发出的新方法是对众多基因沉默法的一种有效补充。

    如果你要想了解一个东西的重要性如何，那就暂且抛开它一会儿看看会出现什么情形。通过RNA干涉获得的基因沉默法在很多实验室已经成了一种常规方法，应用它可以检验某一基因的重要性如何。遗憾的是，尽管这一方法的应用前景及广度十分被看好，RNA干涉并不是在任何情况下都起作用。这样情形就促使David Corey领导的研究小组设法寻找除mRNA之外的其它干涉位点。David Corey说：“我们认为，转录起始位点很可能是对基因抑制十分敏感的位置。”他领导的研究小组最近发表在《自然-化学生物学》上的两篇论文，介绍了相关研究结果。

    他们设计出了一种缩氨酸单链(PNA)，它可以看作是一种特殊的DNA模拟链；他们同时还设计出了RNA寡核苷酸双链。这两种设计物都能识别目标转录起始位点周围的DNA序列。感染有抗基因的PNA或RNA的细胞能高效降低基因表达，而那些仅有几次错配的探针却不具有这一特征。这里的PNA/RNA对于转录起始位点来说具有完美的补充作用。在Corey看来，这些结果表明，它们是以基因组DNA为目标靶点的，转录起始位点是一个极好的用于促使基因沉默形成的干涉位点。他的研究小组一直用抗基因RNA法来检测五个以上基因片段的转录起始位点，每次都获得了很理想的“基因沉默”效果。因此，该研究小组认为他们的这一方法可以作为一种广谱的基因沉默试验方法。

    Corey并不是宣称PNA/RNA抗基因方法完全替代mRNA目标法，他的观点是两种方法是相互补充的。他说：“应该对这两种方法进行并行对比，从而可以发现哪种方法在定位细胞核染色体与定位细胞质mRNA的对比中具有更大的优势。”在一些情况下，定位基因比定位mRNA更具有说服力，因为每个细胞中仅有两套基因，但有多套mRNA。同时，PNA/RNA抗基因探针的设计比起RNA干涉靶点的寻找更为容易，因为前者是针对一个明确的DNA序列，因此并不需要复杂的运算法则来预测哪种序列可作为一种理想的干涉靶点。

    各种基因沉默法的用途在很多情况下是明显的，基因下调之后的显性表达是更为灵敏。Corey推测，一个人如果反复观测到同样的显型，无管DNA/RNA是否为寻找中的目标物，其结果都是十分有价值的，绝不属于那种所谓的人造结果。

    对于Corey来说，激动的原因不仅在于抗基因RNA作用于沉默基因的高效性，而且在于机制方面的意义。他认为：“更有意义的是，在哺乳动物细胞中RNA能够识别DNA，它的重要性才刚刚被认识到……这一方法如此有效，以致于我们很难相信它与自然调控无关。”通过RNA识别转录起始位点获得的基因沉默也许是人们对于自然界本来具有的某一机制的具体应用，它为我们开发一种新型细胞调控方法提供了借鉴。

    注：夏雨译自2005年10月号的《自然-方法学》，版权为英国NPG出版集团所有。(http://www.ebiotrade.com/)