为克服研究所带来的局限性，中国科学院将在未来几年内大力建设科技创新基地，以加强科技创新能力建设为主线，凝聚目标，提高加快发展科技生产力的能力。

　　尽管知识创新试点工作取得诸多成绩，但是中科院发展仍然存在一些深层次问题，在体制机制方面，凝练提升重大科技创新目标、组织开展跨所、跨学科重大科技创新活动的有效机制尚有待健全，中科院的综合优势未得到有效发挥。

　　“我们要在充分发挥研究所科技创新自主权的同时，建设若干科技创新基地。”中科院院长路甬祥在20日举行的中科院2005年度工作会议上指出，科技创新基地建设要从国家战略需求出发，确定战略方向，凝练重大目标，发挥综合优势，加强集成创新，着力提高解决当前和未来我国经济社会发展的重大科技问题的能力，着力提高为落实科学发展观提供知识基础和技术支撑的能力，着力提高保障国家安全的能力，力争在未来5年，为我国的经济建设、社会发展和国家安全，做出更多基础性、战略性和前瞻性的重大科技创新贡献。

　　研究所和科技创新基地有何区别？路甬祥指出，研究所是科学院的基本组织单元，是某一学科或领域的科技国家队，而科技创新基地是集成创新资源，组织重大创新活动的重要基础，是凝聚科学院创新能力、进行系统集成的重要平台，也是克服研究所局限，充分发挥科学院科技国家队和在国家创新体系中的骨干、引领作用的组织保证。“我们将坚持以体制改革和管理创新为突破口，探索构建矩阵式、网格化的科技创新管理体制。”

　　路甬祥指出，创新基地主要开展战略研究，凝聚重大科学目标和重大应用目标，部署重大创新方向，组织重大创新项目，建设重大创新平台。