在RNAi效应阶段,siRNA双链结合一个核酶复合物从而形成所谓RNA诱导沉默复合物(RNA-induced silencing complex, or RISC)。激活的RISC通过碱基配对定位到同源mRNA转录本上,并在距离siRNA3’端12个碱基的位置切割mRNA。切割的精确机制现在还是在不断研究之中,作用示意图见下。
科研人员利用X射线晶体成像的方法构建了Dicer酶的三维结构图。通过对三维结构的研究,科学家发现Dicer酶不仅仅起到一个分子切割的作用,它还能起到一种精确度量的作用。Dicer酶在高等动物中普遍存在,包括人类,是一个被广泛研究的酶。它在2001年,也是由一位HHMI研究Gregory J. Hannon发现的。因为它可以剪切RNA从而触发选择性基因沉默,因此在癌症和其它发育过程研究中广泛应用。
原文:Structural Basis for Double-Stranded RNA Processing by Dicer Ian J. MacRae, Kaihong Zhou, Fei Li, Adrian Repic, Angela N. Brooks, W. Zacheus Cande, Paul D. Adams, and Jennifer A. Doudna Science 13 January 2006: 195-198. The RNA binding site of the small RNA--generating enzyme Dicer is located 65 Å from the two RNA cleavage sites, reliably producing ~25-nucleotide RNA fragments.