生物通报道：CuraGen Corporation公司（NASDAQ: CRGN）旗下拥有其多数股权的子公司454 Life Sciences公司11月15日宣布，他们利用454 SequencingTM将穴居人DNA序列与人类、黑猩猩的基因组序列进行比对，发现现代人类和穴居人祖先在距今大约50万年以前分道扬镳，并且他们共同祖先的population的有效大小（effective size）与现代人类的population的有效大小相差无几。研究结果刊登于Nature杂志，文章题目为《Analysis of one million base pairs of Neandertal DNA》。
马克斯－普朗克协会进化人类学研究所（Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology）所长Svante Pääbo说：直接对穴居人化石样本中提取的DNA进行高通量454测序，测序结果成为穴居人基因组（包括与人类核DNA序列相似的一百万对碱基）研究的一项重要组成部分，我们对穴居人全基因组进行测序的信心更加坚定了。对穴居人基因组进行测序，为鉴别现代人（解剖学定义）基因组特异遗传变化提供了独到的帮助。
关于相同穴居人化石样本的一篇平行报道也刊登于本周Science网络版。Pääbo 在Science文章说：“实验过程包括传统的建库（library preparation，生物通编者译）步骤，90％以上的碱基对都经过454测序。”
“能在Nature和Science上发表文章，是对454测序技术的进一步肯定，说明我们逐步成为广泛、快速、准确测序任何基因组，甚至已经发生高度降解的样本的基因组的金标准，” 454 Life Sciences公司CEO Christopher McLeod 说，“我们相信与测序任何个体人类基因组相比，穴居人基因组研究结果能够为人类生物学带来更多的发现。”
由于细菌DNA对化石样本的污染，测序穴居人基因组与测序人类基因组相比，需要做的工作更多。454 Life Sciences公司研制的Genome Sequencer 20 系统克服了这一障碍，一台 Genome Sequencer 20能够在五小时内，对小量骨化石中的约25万单一DNA序列进行测序。所确定的DNA序列长度为100－200bp，古DNA片段（ancient DNA fragments）长度恰好吻合。
穴居人测序小组今后两年中打算绘制30亿个碱基对组成的穴居人基因组草图，中期目标是完成穴居人线粒体基因组测序，以对“穴居人母体DNA对现代人类DNA有无捐献”这个问题做出回答。
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.（生物通记者 小粥）
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