生物通报道：蛋白质生命活动的真正执行者，对其功能的研究具有重要的生物学意义和利用价值。而蛋白质三维结构的确定为蛋白质功能的确定提供重要线索。长期以来，研究人员花费大量的心血来分析蛋白质的三维结构。虽然这些复合体结构可以显露出蛋白质功能的丰富信息，但是这些分析工作相当困难和费时。

来自霍华德·休斯医学院的研究人员David Eisenberg表示，新的结构性基因组学方法可以加速个别蛋白质的研究，但是对于许多复合体蛋白质却无能为力。

因此研究人员认为有必要开发出一种新方法，以分析蛋白质复合体的结构。在发表在2006 年5月8 日Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS)的网络版上的一篇文章，霍华德·休斯的研究人员描述了一种基因组和结构分析法，该方法可以使这些蛋白质复合体的结构越来越清楚。

研究人员利用他们的新方法测定一种结核杆菌特有的蛋白质复杂结构。由于这种只存在于结核分枝杆菌中的蛋白质PE/PPE相当复杂，所以可以作为药物研发的靶标，进而研制出比抗生素更有效且更具专一性的疗法。

这套技术思路是先进行基因组分析来推断复合体的两种蛋白质功能是否有相关性。例如，如果编码蛋白质的基因相邻在一起，那么这两种蛋白质可能在细胞中以复合体的方式出现。

接着，研究人员为蛋白质设计出表达的基因，并以大肠杆菌细胞作为表达系，然后确认这些蛋白质是否会形成配对的复合体。最后，研究人员利用标准结构分析技术确定出纯化的蛋白质结构。