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华人科学家《自然》封面解开核小体之谜
关键字:核小体|《自然》封面    www.ebiotrade.com  时间:2006-8-22    来源:生物通

生物通综合:来自世界著名的学术研究机构以色列Weizmann Institute of Science,以及美国西北大学(Northwestern University)分子生物学与细胞生物学等系的研究人员一道发现了核小体与DNA序列结合的秘密。这一研究
进展公布在最新一期(8月17日)Nature杂志封面上。

主持这一研究的是西北大学的Ji-Ping Z. Wang和Weizmann科学院的Jonathan Widom。


(图片为带有几个核小体的一段染色质)

真核基因组在活体中不以裸露DNA形式存在,但在被称为染色质的蛋白-DNA复合物中是以裸露DNA形式存在的。染色质含有核小体,它们是紧紧包裹在一个组蛋白核心周围的短DNA片段,排斥大多数结合DNA的蛋白,所以起抑制剂的作用。在一项研究工作中,研究人员将计算方法和实验方法结合起来,用以确定核小体对DNA序列的偏好,并预测整个基因组范围内核小体的组织。酵母基因组编码一个内在的核小体组织,这可以解释活体中核小体位置的大约一半。该编码在不同真核细胞中都高度保留了下来,它的作用是将转录因子引导到它们的结合点,并辅助很多其他的特定染色体功能。

原文:
Nature 442, 772-778(17 March 2006) |
doi:10.1038/nature04979; Received 16 March 2006; Accepted 14 June 2006; Published online 19 July 2006
A genomic code for nucleosome positioning
Eran Segal1, Yvonne Fondufe-Mittendorf2, Lingyi Chen2, AnnChristine Thåström2, Yair Field1, Irene K. Moore2, Ji-Ping Z. Wang3 and Jonathan Widom2
[Abstract]

另外Nature杂志一篇配发的News and Views文章讨论了DNA序列和其他调控因子在核小体定位中所起的作用。
Genomics: Predictable packaging p750
Nuclear factors must access specific sites within genomic DNA to function, yet the DNA is bundled up into many nucleosomes. Is the DNA sequence sufficiently informative to predict where each nucleosome will be?
Timothy J. Richmond
生物通:万纹)

附:Ji-Ping Wang 
Assistant Professor of Statistics
Ph.D., 2003, Pennsylvania State University

Research Interest

1.Mixture model, computing algorithms and applications
2.Species problem, capture-mark-recapture problem
3.Bioinformatics and genomics

Honors and awards

1.Distinguished Student Paper Award, 2004, ENAR, Pittsburgh
2.Travel fund award, Penn State 2002
3.Vollmer-Kleckner Scholarship, Penn State 2001

Software Developed

ESTstat V1.0: Quantitative EST library analysis tool

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