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07年完成基因组测序的生物
【字体： 大 中 小 】 时间：2007年12月14日 来源：生物通
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在即将过去的2007年，动物、植物、微生物的基因组测序工作进行的如火如荼，多项基因组测序结果被公布，包括第一个个人基因组图谱、马基因组图谱、肺癌基因组图谱和多种致病性细菌的基因组测序结果。
生物通报道：在即将过去的2007年，动物、植物、微生物的基因组测序工作进行的如火如荼，多项基因组测序结果被公布，包括第一个个人基因组图谱、马基因组图谱、肺癌基因组图谱和多种致病性细菌的基因组测序结果。
人类基因组测序的进一步深入
57年前，美国生物学家詹姆斯·沃森与弗朗西斯·克里克共同发现了脱氧核糖核酸(DNA)分子结构的双螺旋模型，并因这项基因研究领域的重大突破获得诺贝尔奖。今天，沃森成为自己研究的受益者--他将成为世界第一份完全破译的“个人版”基因组图谱的拥有者。
来自美国克莱格凡特研究所（J. Craig Venter Institute，由TIGR所建立），加拿大多伦多大学，加州大学圣地亚哥分校，西班牙巴塞罗那大学（Universitat de Barcelona）的研究人员近期公布了单个个体二倍体基因组序列，为未来的基因组比较打开了一道门，也开创了个体基因组信息的新纪元。
来自杜克大学的研究人员创造了第一张人类基因组印记基因（imprinted genes）图谱，并且他们表示其成功的关键在于一个称为机器学习（machine learning）的人工智能形式：modern-day Rosetta stone。这项研究新发现了四倍于之前识别的印记基因，并即将公布在
完成测序的动物
国际马类基因组序列计划（the international Horse Genome Sequencing Project）宣布，科学家们首次完成家马（(Equus caballus)）的基因图谱草图，得到了270万个DNA碱基对的数据，全部数据已经进入公共数据库，可免费供全世界的生物学家和兽医学家使用。
一种灰色短尾负鼠（Monodelphis domestica）的基因组测序的完成则为这一推测给出了切实的证据。负鼠是第一个完成基因组测序的有袋动物，测序结果公布在
在新一期的《Genome Research》杂志上发表的一篇文章公布了对家猫(Felis catus)基因组的首个装配、注释和比较分析详细信息。
研究人员对一只四岁大的名叫Cinnamon的阿比西尼亚猫（Abyssinian cat）的DNA进行了测序。之所以选取这种猫是因为对它的血统很了解，能够追溯到几代前的瑞典。
在最新一期的《基因组研究》杂志的网络版上，来自美国科罗拉多卫生科学中心大学和斯坦福大学的研究人员公布了一项大规模基因组研究的结果。
该研究的目的是分析调查10种包括人类在内的灵长类动物之间基因复制数量的差异，剩余九种灵长类动物分别为黑猩猩、大猩猩、倭黑猩猩、猩猩、长臂猿、短尾猿、狒狒、狨和狐猴。这项研究系统地分析了不同种系灵长类动物的基因和基因簇。在漫长的6000万年的进化过程中，这些基因曾发生过基因拷贝数的增加和缩减。
美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下，即小鼠基因组单体型图谱（将染色体分隔成许多小的片段），从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在
登革热是一种由登革热病毒所引起的传染病，受感染后所产生的临床病征从非特异性症状，到严重可致死的出血热皆有可能。这种疾病的主要传播者则是伊蚊。
现在，埃及伊蚊首个基因组草图的完成将为研发预防和控制登革热和黄热病的新药物和疗法奠定基础。这项研究计划的主要负责人是美国基因组研究所的Vishvanath Nene和法国Notre Dame大学的David Severson。这个基因组是包含了基因和其他DNA片段的完整一套的遗传物质信息。这项研究的结果发表在
包括人类在内的现代哺乳动物并没有进化出太多新的基因，而是常常对已有基因进行重新编排。在这个过程中，之前被认为是垃圾的遗传成分起到意外的辅助作用。
基因组学专家多年来一直只是推测垃圾DNA有这种功能，而现在一种灰色短尾负鼠（Monodelphis domestica）的基因组测序的完成则为这一推测给出了切实的证据。负鼠是第一个完成基因组测序的有袋动物，测序结果公布在
测序的植物
一项由法国科学家领导的最新研究捍卫了法国作为“葡萄酒之都”的荣誉，他们完整测定了一种葡萄的基因组。葡萄也由此成为人类完成基因测序的第一种水果作物和第四种开花植物（其它3种分别是小麦、拟南芥和白杨木），这有望加深科学家对开花植物进化过程的理解。相关论文
阿联酋迪拜生物技术和基因工程区域中心计划测序海枣（date palm）的基因组。根据该中心的网页上的消息，该中心董事会日前为开始进行灵活的研究计划开出绿灯。而海枣计划将是该中心向着好的方向发展的开端。这种研究计划旨在利益海枣的基因组数据来确定或者开发出对付那些威胁这种植物的疾病的方法。研究人员将会在阿联酋大学海枣中心进行这项研究计划。阿联酋是世界第四大海枣生产国。
测序的微生物
一个国际研究队伍公布了一种具有极强抗药性的结核杆菌基因组的初步数据。哈佛大学公共卫生学院的研究人员表示，该项目的目定是开发出一种能迅速诊断这种疾病的检测方法。这种所谓的结核分枝杆菌的XDR株与最近在南非KwaZulu-Natal爆发的导致50多人死亡的疫情有关。迄今为止，在该地区已经确定出了超过300个XDR病例。
到目前为止，科学家已经积累了大量的基因组数据“矿藏”。而那些被忽略的数据则可能揭示出非比寻常的重要信息。现在，美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)进行的一项对大量微生物基因组序列数据的系统性的再次分析正是这样的一个绝佳例子。这项研究鉴定出了杀死了测序过程中使用的细菌的基因。该研究还给出了发现新抗生素的可能策略。这项研究的发现刊登在
荷兰工业化学公司DSM已经完成了一项测序黑曲霉（Aspergillus niger CBS513.88）基因组的合作计划。DSM公司利用这种黑曲霉来生产酶和其他化合物。DSM和它的合作者们将这项测序计划的结果公布在2月号的《自然·生物技术》杂志上。DSM表示，除去该公司外，参与这项测序计划的还有29个研究机构，包括Gene Alliance、Biomax、Affymetrix、阿姆斯特丹大学等。这种A. niger的基因组大约有3390万个碱基对，并且构成超过14000个独特的基因。其中大约6500个基因的功能将被确定。
（生物通雪花）
