质谱分析获得人类蛋白相互作用大型图谱

　　

生物通报道：来自加拿大多伦多Protana公司（现为Transition Therapeutics），Infochromics，以及渥太华大学（University of Ottawa）系统生物学研究院，多伦多大学等处的研究人员利用高通量质谱仪（IP-HTMS）以及免疫共沉淀技术的大规模应用，对人类细胞中338个诱饵蛋白（bait proteins）进行分析，得到了六千多对蛋白相互作用数据，为蛋白相互作用研究提供了重要的资料信息。这一研究成果公布在《Molecular Systems Biology》（Nature出版社出版的期刊之一）杂志上。

原文摘要：
Molecular Systems Biology 3 Article number: 89 doi:10.1038/msb4100134
Published online: 13 March 2007
Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry
[Abstract]

随着2000年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘，蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。蛋白-蛋白相互作用（PPI）几乎决定着所有的生物功能，因此对酵母、果蝇、线虫以及人类蛋白的大规模相互作用图谱的相继完成，不仅是对系统研究细胞内各种生命活动有着重要意义，也标志着蛋白质相互作用研究方法的不断发展和完善。

但是针对蛋白与蛋白相互作用的研究是一个繁琐的过程，这主要是因为每次蛋白相互作用的伴体都不同，目前随着现在生物技术的发展，特别是高通量技术的出现，以基因组为基础的技术能够帮助科学家们建立蛋白—蛋白，蛋白—DNA相互作用大型相互作用图谱。

在这篇文章中，研究人员利用高通量质谱仪（IP-HTMS）以及免疫共沉淀技术的大规模应用，对人类细胞中338个诱饵蛋白（bait proteins）进行了分析，得到了2371个不同蛋白之间的6486个蛋白相互作用数据。这一数据通过之前已出版的和预测的人类蛋白相互作用进行了交叉验证（cross-validated），其深入挖掘表明这是一个与人类疾病相关的新颖蛋白-蛋白相互作用有价值的数据库，而且研究人员也从中发现了许多新的蛋白相互作用以及途径相关性。
（生物通：张迪）

附：

（蛋白相互作用完全图谱（包括诱饵蛋白和捕获蛋白））