帮助嗜氯细菌清理人类有毒废物

　　

生物通报道：科内尔研究人员希望弄清某种细胞降解污染物的机制，提高其清理有毒废物的效率。产乙烯脱卤拟球菌(Dehalococcoides ethenogenes)是科内尔James Gossett教授于1997年首次在希腊伊萨卡岛的下水道中发现的。科内尔微生物学教授Stephen Zinder对其进行了分离和研究。它们能够除去全氯乙烯（perchloroethylene ，PCE）和三氯乙烯（trichloroethylene ，TCE）等致癌化合物中的氯原子，留下没有毒性的成分。目前，这种细菌已经被广泛应用于清除这些致癌化合物的毒性。

D. ethenogenes应变力会随着环境的变化而变化，没有人知道真正的原因。实际上，人们对这种菌的生活机制了解的很少，因为这种菌在皮氏培养基中很难生长，常规实验室程序得到的结果有限。科内尔土木与环境工程副教授Ruth Richardson，在Gossett和Zinder的成果上，继续研究这种细菌。

Richardson与GNS公司（Gene Network Sciences）合作。GNS公司擅长以计算机模拟生化过程，制作细菌内部工作的计算机模型。Richardson解释说，细菌在培养基中开始时候是生长的，但随后停止，我们应该改善这些培养条件。她发现D. ethenogenes需要维生素B-12，因此向培养基中添加维生素。与其它细菌共生时，D. ethenogenes生长状况更好，“它需要从其它生物得到一些因子，我们不知道这些是什么。”

                

                Dehalococcoides ethogenes菌及其基因组（含1640个基因）

Richardson小组将在各种条件下检测D. ethenogenes，如将它们逐个暴露于不同的了氯化化合物，改变环境或者营养成分，然后观察基因表达和蛋白的生产情况，将实验数据送往GNS。GNS尝试建立每种条件下的细菌蛋白图谱的计算机模型，判断该菌在各种条件下对PCE和TCE的途径是否相同，如果不同，找出共有的步骤。

这是一个反复的过程。如果模型显示改变一个特定条件会导致特定结果，Richardson将进行实验室试验，验证结果是否与模型相符，最终找到一些共同点。找到负责清理污染物的基因为治理其它类型的污染，如PCB、氯苯或氯酚等提供了参考。（生物通 小粥）