最新Nature：大规模基因组研究

　　

生物通报道：2005年美国国立癌症研究协会（the National Cancer Institute, NCI）和国家人类基因组计划研究协会（the National Human Genome Research Institute, NHGRI）各投入资金5千万美元，准备进行一项为时3年的癌症基因组试验性质的计划，主要目的是分析全面测序癌症基因序列改变是否对了解癌症和获得新的诊断治疗方法有一定的帮助。

当时就有人对此表示了怀疑，认为这项计划过于天真了，因为这一癌症基因组测序信噪比需要6到7维尺寸，很难操作。但是经过3年，这一计划有了初步的研究成果，在本期（10月23日）的《Nature》杂志上就公布了两项癌症基因组的相关研究成果。

第一项目研究成果就是有关于成胶质细胞瘤的，这是一类起源于神经上皮组织的肿瘤，它包括星形胶质、少支胶质、室管膜等组织的肿瘤。胶质细胞瘤在颅内各类型肿瘤中发病率为第一位。

在这项研究成果中，研究人员发现了与成胶质细胞瘤有关的基因，其中包括一些肿瘤抑制因子（NF1、RB1、ATM和 APC）和几个酪氨酸激酶基因。从而帮助科学家们重新认识了这些细胞因子，揭示了成胶质细胞瘤的生长过程中的细胞途径的全景，为治疗和预防这种疾病意义重大。

第二项大规模基因组研究虽然不属于TCGA的范围，但是也是一项重要的基因组研究成果，在这篇文章中，来自美国华盛顿大学医学院，哈佛麻省总研究院以及德国的研究人员在188个原发肿瘤样品中对与肺癌相关的突变进行了分析，发现了人类26个促使肺癌发生的重要的基因。

肺癌是一种常见的肺部恶性肿瘤，其死亡率已占癌症死亡率之首。绝大多数肺癌起源于支气管粘膜上皮，近年来，随着吸烟和各种环境因素的影响，世界各国特别是工业发达国家，肺癌的发病率和病死率均迅速上升，死于癌病的男性病人中肺癌已居首位。

这项研究中，研究人员对超过600个与肺腺癌（adenocarcinoma）已知或潜在联系的基因进行了测序，目的是寻找最容易产生变异的那些基因。他们的假设是如果一个基因在多个肿瘤样本中都出现变异，那么可以肯定它在肺癌的发病过程中有重要的意义。而这些变异在肺癌患者体内的健康组织中也是不会出现的。

结果研究人员发现其中26个基因以高频率发生突变，表明它们在致癌过程中发挥直接作用，说明现有的一些药品可能是对肿瘤发生特定变异的人群才有效，了解了这些信息，就有助于研究人员有靶向的进行癌症治疗。

（生物通：张迪）