Nature:首个癌症全基因组图谱 照亮癌症治疗的前路

【字体: 时间:2008年11月07日 来源:Nature

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生物通报道,华盛顿大学基因组研究中心,医学院,遗传学系,病理和免疫学系的科学家近期首次完成了白血病患者的完整基因组测序工作,该项工作为白血病的遗传学研究引入了新的视角。相关的成果公布在11月6日Nature上。

  

生物通报道,华盛顿大学基因组研究中心,医学院,遗传学系,病理和免疫学系的科学家近期首次完成了白血病患者的完整基因组测序工作,该项工作为白血病的遗传学研究引入了新的视角。相关的成果公布在11月6日Nature上。

 

急性髓性白血病(acute myeloid leukemia,AML),一种恶性的血液肿瘤疾病,多发与成年人儿童发病率低,在美国每年有13000成年人受该病的困扰。

 

近20年来,急性髓性白血病的治疗手段没有多大改变,主要的原因在于对其遗传背景了解不多。

 

随着测序技术的发展,测序费用大大降低,对急性髓性白血病患者的基因组进行全面的测序的价格变得合理化,并且测序的结果更可靠。因此,Richard K.Wilson领导的研究小组决定对患者的基因组进行测序,找出引发白血病的突变基因。

 

为此华盛顿大学基因组测序中心组成了庞大的研究队伍,他们选取了一个患有急性髓性白血病的妇女为研究对象,该妇女在50岁时因救治无效死于急性髓性白血病。

 

研究小组对患者取得样品后,通过测序获得了急性髓性白血病患者的全基因组图谱,为了找出突变的基因,研究小组从对照者的皮肤中取得样品获得了全基因组图谱,将两者进行比对。

 

最终发现了10个发生了后天性突变的基因,其中2个就是先前研究者已经找出的基因,这2个基因主要促进癌症的发生。有趣的是另外8个基因在所有的癌症细胞中都存在,但是关于它们的功能现在科学家们了解的很少。

 

研究者称,这一成果将为癌症的靶位治疗带来新的契机。

 

原文摘要:DNA sequencing of a cytogenetically normal acute myeloid leukaemia genome

 

【Abstract】

Acute myeloid leukaemia is a highly malignant haematopoietic tumour that affects about 13,000 adults in the United States each year. The treatment of this disease has changed little in the past two decades, because most of the genetic events that initiate the disease remain undiscovered. Whole-genome sequencing is now possible at a reasonable cost and timeframe to use this approach for the unbiased discovery of tumour-specific somatic mutations that alter the protein-coding genes. Here we present the results obtained from sequencing a typical acute myeloid leukaemia genome, and its matched normal counterpart obtained from the same patient's skin. We discovered ten genes with acquired mutations; two were previously described mutations that are thought to contribute to tumour progression, and eight were new mutations present in virtually all tumour cells at presentation and relapse, the function of which is not yet known. Our study establishes whole-genome sequencing as an unbiased method for discovering cancer-initiating mutations in previously unidentified genes that may respond to targeted therapies.

生物通 张欢

 

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