聚焦08突破:膜蛋白的晶体结构

【字体: 时间:2008年12月26日 来源:生物通

编辑推荐:

  除了炙手可热的iPS技术,08年还有一些技术的突破值得我们关注。例如,膜蛋白的晶体结构。一些结构生物学家逐渐开发出新方法,来解决膜蛋白表达、溶解和结晶的瓶颈。2007年以来,一些GPCR的晶体结构陆续被报道。

  

膜蛋白在整个蛋白质组中大约占了三成,但在PDB的结构库中,还不到可怜的1%。这并不是因为膜蛋白不重要,相反,膜蛋白受体是绝大多数药物的靶点。其配体覆盖蛋白、肽段、糖类、脂类及其他多种有机分子。晶体结构对膜蛋白而言尤其重要。试想一下,如果你了解它们的结构,再去理解突变、配体及相互作用分子等,应该会变得更简单。对于药物开发而言,3D结构能指导人们去开发小分子药物。

现实中主要的瓶颈在于无法大量表达膜蛋白,没有合适的去污剂来溶解它们,以及其固有的结构松散性。G蛋白偶联受体(GPCR)通常很大,疏水结构多,有许多松散的环。第一个发表的GPCR结构是牛视紫红质,时间是2000年。为什么它能成为第一?因为它能从牛眼睛中大量纯化,而没有表达上的限制。此后,GPCR的晶体结构就一直局限在视紫红质。

但是技术在创新,方法在改进。一些结构生物学家逐渐开发出新方法,来解决膜蛋白表达、溶解和结晶的瓶颈。七年的沉寂之后,终于有一些GPCR的晶体结构陆续被报道。美国斯坦福大学医学院的Rosenbaum等人通过两条途径来解决GPCR结晶上的疑难杂症。对于β2肾上腺素受体,关键的问题在于其松散的胞内环。Rosenbaum等用T4溶菌酶取代了第三个胞内环的大部分,而蛋白保留了近似原始的性质。另一方面,他们则用一种单克隆抗体来靶定第三个胞内环,发现这个抗体对于获得晶体衍射非常关键。

结构基因组学小组如美国的NYCOMPS(纽约膜蛋白结构协会)和CSMP(膜蛋白结构中心)以及其他一些国际组织,正在建立高通量的途径来简化膜蛋白结构确定,尽管到目前为止只确定了几个新的结构。同时,无需结晶的固体NMR方法,也在迅速发展,但灵敏度和分辨率仍需进一步提高。

同时,在膜蛋白的表达方面,Invitrogen公司新推出了MembraneMax蛋白表达试剂盒,能得到高产量可溶性的膜蛋白。它的秘密武器就在于其中专利的MembraneMax试剂。MembraneMax™试剂与细胞膜有点类似,外环是一种专利配方的支架蛋白,中间是脂双层。它提供了与细胞内相似的环境,帮助膜蛋白正确折叠,避免了蛋白聚集,同时也省去了反复优化的繁琐步骤。与Invitrogen的Expressway体外表达系统结合,MembraneMax试剂就能生产出微克至毫克级的可溶膜蛋白。更详细的描述请看膜蛋白的表达也能轻松实现。这个试剂盒还入围了2008生命科学十大创新产品评选

当然,对于膜蛋白结构而言,不可能有放之四海而皆准的操作步骤。我们需要多种方法,来确定不同蛋白的结构。今后的几年,我们有望看到膜蛋白的更多解决方案出炉,而PDB中的膜蛋白结构也将与日俱增。

(生物通 薄荷)

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号