浙大、北京基因组所《PLoS ONE》新文章

　　生物通报道：2月13日的《公共科学图书馆•综合》（PLoS ONE）杂志刊登了中国科学院北京基因组研究所基因组科学及信息重点实验室胡松年研究员与浙江大学华跃进研究员共同指导完成的一篇新研究论文。论文的题目为“A Novel OxyR Sensor and Regulator of Hydrogen Peroxide Stress with One Cysteine Residue in Deinococcus radiodurans。” 耐辐射球菌(Deinococcus radiodurans)是迄今为止发现的对电离辐射、紫外线、过氧化氢等一些DNA损伤剂都具有极强抗性的微小球菌。公认的耐辐射球菌有3种DNA修复方式：碱基切除修复、核苷酸切除修复和重组修复。但DNA修复过程的启动机制和修复的分子机理却知之甚少。 在细菌中，OxyR是过氧化物受体和转录调节元件，它能感受活性氧的存在并诱导抗氧化系统的功能。当细胞感受到时，OxyR蛋白通过两个保守的半胱氨酸残基（C199和C208）的二硫键的形成而被激活，在耐辐射球菌中，发现了一个基因DrOxyR基因具有特殊的特征，即它只有一个保守的半胱氨酸。 Dr0615的突变体对H2O2表现超敏感，但对电离辐射不甚敏感。定点突变和体内功能分析表明，DrOxyR蛋白的C210对感受H2O2是必须的，定量PCR和转录丰度分析表明，DrOxyR既是转录激活子也是转录抑制子，能调节Mn/Fe的平衡。本研究表明，OxyR家族基因可以分为两类：2-Cys类和1-Cys类. 胡松年教授是中科院北京基因组研究所研究员，博士生导师，浙江大学兼职教授。主要从事基因组学、分子生物学及分子遗传学方面的研究。1991年于天津商学院食品工程专业获学士学位，1996年于中国农业大学生物学院植物生化系获博士学位。1996–1998 年在中国医学科学院基础医学研究所任助研。1998–1999年在美国西雅图华盛顿大学基因组中心任访问学者。1999–2001年任中科院遗传所人类基因组中心暨北京华大基因研究中心总工程师。2002-2003年任杭州华大基因研发中心主任。现任中科院北京基因组研究所暨北京华大基因研究中心中心实验室主任。作为项目负责人和主要参加者参与完成了国家“863”、“973”、国家自然科学基金重大项目以及中国科学院创新工程项目等包括“水稻基因组计划”、“人类基因组计划1％项目”、“腾冲嗜热厌氧菌全基因组序列分析”等多项国家和中国科学院重大课题，其中主持课题5项。共发表论文40余篇，发表专著 《基因组数据分析手册》1本，参与编著2本。 1998年至1999年作为访问学者到美国西雅图华盛顿大学基因组中心工作其间，系统地掌握了大规模基因组测序的全部技术和管理模式，并对当时的测序反应及上机进行了优化，既降低了测序成本又提高了测序效率。1998年9月回国后，即参加了中科院遗传所人类基因组中心实验室的筹备工作，是国内较早进行大规模基因组学研究的科研人员之一。1999年4月开始负责规模化测序平台的建立与人员培训，6月成功地完成了4个人BAC共64万碱基对的测序工作，填补了我国在大片段基因组测序上的空白，同时初步确立了测序流水化生产、企业化管理的运作方式。9月在我国加入国际人类基因组测序计划后，成为北京华大基因研究中心国际人类基因组测序计划中国部分（1%项目）具体执行的总负责人。在“1%项目”的胜利完成和高质量、高效率、低成本、高产出的大规模测序技术平台的建立中起了重大作用。 在继续完成国际人类基因组测序计划中国完成图部分工作的情况下，近年来先后承担了 “籼稻基因组测序”、“中国－丹麦家猪基因组测序”及“产黄青霉菌基因组测序”等重大项目，其中“人类基因组框架图”与“籼稻基因组框架图”的工作先后于2001年2月和2002年4月发表在Nature 和Science杂志上。 华跃进教授，现任浙江大学应用生物科学系主任、原子核农业科学研究所所长、浙江大学生物物理学科带头人、中国比较内分泌学会理事、中国原子核农学会常务理事、浙江省原子核农学会理事长、日本东京大学大学院客座教授。 1994年在德国马堡大学医学院获得理学博士学位。1995~1999年在日本农业生物资源研究所进行博士后研究。1999年回国工作。2004年获得国家杰出青年基金，同年入选“****奖励计划”。目前的主要研究方向为耐辐射细菌的基因结构和功能、DNA修复机制等。 1999年在世界上首次从家蚕脑分离鉴定了昆虫前胸腺抑制肽（PSTP），开辟了昆虫神经内分泌学研究的一个新领域。近年来，在耐辐射球菌的DNA修复机制的研究方面取得重大进展，发现和鉴定了一个通过调控 recA、pprA 等基因表达来增强DNA修复能力的关键因子PprI。现主持国家自然科学基金重点项目、国家重点基础研究计划（973）等项目。主持完成的研究成果“DNA修复开关基因的发现与鉴定”入选“2003年度中国高校十大科技进展”。（生物通雪花）