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Nanodrop:只要1微升就可以检测核酸/蛋白浓度
【字体: 】  www.ebiotrade.com  时间:2004年11月05日    来源:生物通
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摘要: 分光光度计是实验室检测核酸或者蛋白样品浓度最常用的仪器之一。但是对于提质粒、提基因组DNA、纯化RNA或者是PCR产物

分光光度计是实验室检测核酸或者蛋白样品浓度最常用的仪器之一。但是对于提质粒、提基因组DNA、纯化RNA或者是PCR产物,又或者是酶切片断电泳胶回收得到的那一点点少得可怜,以微升计算体积的核酸样品,分光光度计那巨大的比色杯实在是令人望而生畏。大凡做过类似实验的人,特别是要做多个样本的浓度测定的时候——谁不痛恨那些简单却枯燥的重复步骤呢:反复校正、稀释、浓度换算,还有要多次重复清洗比色皿。一想到那些耗费了多少试剂盒或者时间才千辛万苦得到的珍贵样品,有不少要牺牲在那个巨大的比色杯中,就令人心疼。即使是后来推出的底部收窄的一次性比色皿,可以节约不少样品,也要至少50ul以上体积,还浪费比色杯!毛细管也无法解决类似的问题。构建文库过程中,经过重重艰苦实验得到的cDNA合成产物要过柱纯化分段回收或者定量时,测定浓度牺牲的样品太多会影响结果,真可谓痛苦的检测。所以我们经常偷懒。但是太多的教训告诉我们,忽略浓度检测决不是良好的实验习惯。

看到NanoDrop超微量高精度紫外/可见光光度计的资料时就不住的感叹,早有这个我们可以节约多少时间啊!只要1微升样本体积,直接用加样器将待检测样本加在检测台面上,无需使用比色皿或者毛细管,10秒钟完成检测。而且检测范围超宽,无需对样本进行稀释——可以检测 2—3700ng/μl(dsDNA),0.1mg/ml-100mg/ml(蛋白)范围内的样品!无需比色皿或者毛细管,节省消耗品费用,又不浪费样本,这就是220nm-750nm全波长紫外/可见光谱扫描的NanoDrop超微量高精度紫外/可见光光度计。

特点

  • 检测只需1微升的样本,适用于极微量样本的检测
  • 直接使用加样器将待检测样本加在检测的表面上,无需使用比色皿和毛细管。不浪费样本,节省消耗品费用
  • 样本无需进行稀释,即可进行快速、简便的检测,检测范围宽

巧妙而简单的构思:

      NanoDrop ND-1000紫外/可见光光度计所使用的技术非常巧妙,最早是由Dupont Agricultural Genomics Lavoratories的Charles Robertson博士所开发的。它自1998年起,就在Dupont实验室广泛地使用。NanoDrop Technologies公司在2000年成立,并拥有了这项技术的所有权,主要致力于开发、生产和销售高质量的实验室仪器,总部位于美国特拉华。

    真的是非常巧妙的构思——我们在日常生活中一定有注意过微量的液体可以在窄窄的缝隙间滞留或者在表面形成的小小液珠——这里只需使用加样器将1微升样本直接加在检测台面上,用两根光纤将样本拉开一点点距离,这样就形成了检测通路,而不需要其他的容器或检测装置,也没有其他容器材料的干扰,机器就自动进行全光谱检测。这就是利用表面张力保持样本形态的专利检测技术。就这么简单,好像每个人都想得到。

    当检测完成后,只需将样本从检测台面上擦净即可。这种简单的清洁方式,可以保证样本之间无交叉污染,不会对后续的检测造成干扰。

应用在所有的紫外/可见的检测:

系统为Dupont genomics labs所设计,可以对众多微量样本进行理想的检测。

  • 检测在芯片实验中Cy-dye标记的效率,可以检测Cy3,Cy5Alexa等荧光标记染料
  • 可以检测浓度最高至3700ng/μl核酸样本的浓度和纯度,而无需进行稀释(DNARNA,寡核苷酸,PCR产物和杂交探针等)
  • 检测蛋白浓度,Bradford和BCA法检测等
  • 检测细胞浓度,如检测悬浮液中微生物的浓度等
  • 因为检测使用的样本量很低,在检测危险样本时,可以提高检测的安全性

ND-1000可以进行紫外/可见光全光谱的分光光度检测,而且它体积小巧(20cm×15cm×12cm),可以适合任何实验室使用。

ND-1000分光光度计实际检测数据:

我们尝试了一系列的实验,来检测ND-1000分光光度计的检测性能。此系统在重复性、检测线性和抗交叉污染上,都能很好地满足实验的需要。

重复性:我们分为DNA,RNA和蛋白质检测三个部分,检测了ND-1000分光光度计的精度和重复性。我们使用260nm的吸收光来检测DNA和RNA,并且自动计算相应的核酸浓度。蛋白质检测使用280nm的吸收光。

1.      RNA:

2.      2.DNA:

3.      3.蛋白质: 

由以上实验数据可见,ND-1000无论是进行DNA,RNA或是蛋白质的检测,标准偏差(SD)相对检测值都很低,可以得到稳定、可靠的检测结果。

线性:将ND-1000分光光度计的检测结果与常规的分光光度计的检测结果进行比较,对比其检测的线性度。

ND-1000分光光度计与HP8452A分光度计检测结果的线性比较

 

样本残余检测:为了检查是否在检测表面上有样本残余,首先检测高浓度液体,再对水进行检测,可以看到,样本之间没有明显的交叉污染。

Sample ID

Date

Time

ng/μl

Water

10/30/2002

2:20PM

1.9

Water

10/30/2002

2:22PM

-0.74

Sample A

10/30/2002

2:34PM

2058.03

Sample A

10/30/2002

2:34PM

2076.72

Water

10/30/2002

2:36PM

-1.14

Water

10/30/2002

2:37PM

0.83

附件:CF-1 Calibration fluid:水性重铬酸钾溶液(K2Cr2O7)用作ND-1000分光光度计的校准。它约比其他用于分光光度计校准的重铬酸钾溶液浓度高10倍。

DYMO Labelwriter 330 label printer:使用这个标签打印机,可以打印大小为2-5/16"×4"有黏性的标签纸,可以方便地在实验笔记本中保存数据。通用计算机联机使用

技术参数:1mm光程长度(可自动调整到0.2mm)

ü          1微升样本量

ü          波长范围:220-750nm

ü          波长精度:1nm

ü          波长分辩率:3nm(FWHM at Hg 546nm)

ü          吸光率精确度:0.003 absorbance (1mm光程)

ü          吸光率准确性:1%(at 0.76 absorbance)

ü          吸光率范围:0.02-75 (相当于10mm光程)

ü          可检测低至2ng/μl的核酸,可检测高至3700ng/μl的核酸

ü          检测周期:10秒

ü          体积:20cm×15cm×12cm

 





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