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北京基因组研究所引进CLC测序分析平台
【字体: 大 中 小 】 时间:2008年07月18日 来源:生物通
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北京基因组研究所(BGI)近日与丹麦CLC Bio公司签署了全球软件使用协议,来使用CLC Bio的新一代测序解决方案-CLC基因组平台(CLC Genomics Workbench)。
北京基因组研究所(BGI)近日与丹麦CLC Bio公司签署了全球软件使用协议,来使用CLC Bio的新一代测序解决方案-CLC基因组平台(CLC Genomics Workbench)。这个软件使用协议覆盖了BGI的所有研究人员,包括国内和国外。
北京基因组研究所生物信息学部门主管李瑞强表示,在测试了几套商业软件之后,我们选择了CLC基因组平台作为我们分析新一代测序数据的平台,主要是因为它的灵活性好,而且能与我们自己的算法相兼容。我们研究院拥有17台Illumina GA分析仪、两台ABI的SOLiD系统和3台Roche/454的新一代测序仪,它们都在满负荷运转,因此高效的数据分析平台对我们而言至关重要。
李瑞强还表示,通过使用这个平台,我们的科学家能很轻松地使用自主研发的算法,来支持和扩展我们的工作流程。因为CLC基因组平台速度快、用户界面友好而且功能齐全,一经使用,立即受到我们内部研究人员的欢迎。
CLC基因组平台是第一个综合的分析系统,能分析和显现所有主要的新一代测序平台的数据,包括Illumina的Solexa、ABI的SOLiD、Roche 454的GS和Helicos的HeliScope。
CLC基因组平台充分发挥了配对末端数据的优势,支持很多特征和工作任务,如基因组的从头拼接、SNP检测、多重分析和高通量加工。如果你想了解更多关于CLC的信息,请访问:http://www.clcbio.com。
(生物通 余亮)