650篇已发表论文中的错误

　　

生物通报道：一些乳腺癌研究人员研究的也许是一种错误的癌症类型——现在越来越多的证据表明一个长达25年的转移性乳腺癌（metastatic breast cancer）研究的“基石”也许来自黑色素瘤细胞（melanoma cells），目前已有650多篇论文用到了这种细胞系。这一事件引起了包括细胞学研究，评论分析和细胞供应商们在内的广泛关注。

事情缘起于2000年发表在Nature Genetics上的一篇论文，乔治敦大学的一个博士研究生 James Rae发现美国国立癌症研究所犯了一个错误。文章分析了NCI的60个人类癌症细胞系的基因表达，其中包括Rae用到的一种细胞系：MDA-MB-435，这也是转移性乳腺癌用的最广泛的模式细胞系，这篇文章中的第一个图表是一个彩色的树状图表，435细胞系用粉红色标明，但是却不与其它粉红色的乳腺癌细胞系在同一列，而是处于乳腺癌与黑色素瘤细胞系之间。

两年后，AstraZeneca的科学家们发现不一样的结果，他们利用RT-PCR和免疫组化方法比较了435和其它9个乳腺癌，黑色素瘤细胞系中的乳腺基因和黑色素瘤基因的表达，结果发现435细胞系没有表达乳腺癌细胞的基因，而是表达了几个通常在黑色素瘤细胞中出现的基因——这一发现促使作者认为435不是乳腺癌研究中的基本细胞系。

此时Rae已经成为了密歇根大学医学院的一名教授，他觉得需要追踪下去，看到底有多少435细胞系与黑素瘤相似。2004年，Rae与其密歇根大学的同事报道称，他们对不同来源的435细胞系来源，包括最初来源（德州M.D.安德鲁癌症中心）的检测中发现所有的435都表达黑素瘤特异性基因，“这些都是同一个细胞系，很可能是黑素瘤。”

然而并不是所有的研究结果都与Rae的结果一致，在同一年，来自M.D.安德鲁癌症中心的研究人员报道说435细胞表达了乳腺特异性标记物，能诱导分泌乳脂质，这是已确认的乳腺癌细胞系的一个特征。

但是Rae并不相信，2006年，他和来自乔治敦的同事利用核型分析（karyotype analysis），比较基因组杂交，单核苷酸多态性分析，以及基因组表达研究又对435细胞系进行了检测，获得了一个明确的结果：MDA-MB-435细胞的真正来源是一个称为M14的黑素瘤细胞系，他们将这一结果公布在Breast Cancer Research and Treatment杂志上。2005年一篇波士顿Dana-Farber癌症研究所（Dana-Farber Cancer Institute）的研究结果也与其一致，同样也利用到了SNP分析手段，他们证明435确实来自于M14。

今天Rae可以毫无疑问的说，“我确认这是一个黑素瘤细胞”，而且Rae2006的论文，以及NCI对435样品的DNA指纹分析都说明435的错误分类早在1982年就发生了，这也就是说对435长达25年的乳腺癌研究也许都是基于一个错误的模式系统。

在这一事实确认后，许多细胞系供应部分就采取了行动，NCI和伯克利实验室——一个乳腺癌细胞系保存处都重新将这个细胞系归入了黑素瘤，ATTC这个著名的细胞系保持处也在3月停止销售这种细胞系，并进行重新鉴定。

其实，细胞系的错误识别并不少见，去年对100个人类细胞系的一个短重复序列的分析中发现18个细胞系被错误归类，但是对于435的错误也许格外的麻烦，因为小鼠这种细胞系的巨大转移特性，有超过650个研究利用435作为乳腺癌模式，并且出版了研究结果——包括今年的60多篇。不过无论这种细胞系属于哪一个类别，研究人员都不愿意更换这种模式细胞系，“人们已经习惯于使用这种细胞系”，Rae表示。