张亚平院士新文章解析基因多态性与SARS易感性

　　

据报道，中国中科院昆明动物研究所和香港中文大学的研究人员19号染色体基因簇多态性研究取得新进展。相关的研究成果发表于《Journal of Medical Genetics》上。

基因多态性是指基因组序列上的变异,它是决定人体对疾病易感性与抵抗力、疾病临床表现多样性以及不同个体对药物反应性的重要因素。在2003年，SARS爆发时，不同地区的不同个体在感染后表现出不同的病程和最终的治疗结果，这被认为是个体本身的遗传因素在这个过程中起了一定的作用，即不同个体在一些基因上的多态影响了他们对一些疾病的易感性。

CD209L基因是19号染色体上C型凝集素家族中的一员，它被证明是SARS病毒的受体，并且它的第4外显子的VNTR多态被认为和宿主对病毒的易感性有关。但是这个结论在其后其他两个研究小组的工作未被得到证实。

 

为了深入探讨这个问题，在中国科学院昆明动物研究所-香港中文大学生物资源与疾病分子机理联合实验室张亚平院士和邓亮生教授的共同指导下，博士生李慧等对19号染色体上C型凝集素家族的4个成员(FCER2， CLEC4G， CD209 和 CD209L)作了全面的研究，采用检测tagSNPs的方法，在C型凝集素家族基因簇上选取了23个tagSNPs位点来代表这个基因簇的多态。检测了来自中国香港的181个SARS病人和172个匹配的正常对照，结果表明C型凝集素家族的4个基因与中国南方汉族群体对SARS病毒的易感之间没有相关性。同时检测了来自中国不同地区的1145个汉族样本CD209L基因VNTR的多态分布情况，结果表明这个位点在中国人群中存在群体分层现象，提示之前的研究小组可能得到了假阳性结果，主要原因可能正是由于他们忽略了这个问题。

 原文检索：Polymorphisms in the C-type Lectin Genes Cluster in Chromosome 19 and Predisposition to SARS-Coronavirus Infection

 

【Abstract】

Polymorphisms of CLEC4M had been associated with predisposition for infection by the SAR-CoV virus. DC-SIGNR, a C-type lectin encoded by CLEC4M, is a receptor for the virus. A VNTR polymorphism in its neck region was recently associated with susceptibility to SARS infection. However, this association was controversial and was not supported by subsequent studies. Two explanations may account for this discrepancy: (1) there may be an unknown predisposition polymorphism located in the proximity which is linked to the VNTR, or (2) it was a spurious association due to unrecognized population structure in the VNTR. We performed a comprehensively genetic association study on this C-type lectin gene cluster (FCER2, CLEC4G, CD209, and CLEC4M) at 19p13.3 by a tagging SNPs approach. 23 tagSNPs were genotyped in 181 SARS patients and 172 population controls. No significant association with disease predisposition was detected. Genetic variations in this cluster also did not predict disease prognosis. But we detected a population stratification of the VNTR alleles in a sample of 1145 Han Chinese collected from different part of China. The results indicated that genetic predisposition allele was not found in this lectin gene cluster and population stratification might cause the previous positive association.  

 

附：
张亚平:中国最年轻的科学院院士

2003年评为中国科学院院士！

中国科学院昆明动物研究所副所长！

中国遗传学会动物遗传专业委员会主任！

全国青联第十届委员会常务委员会委员！

1986年毕业于复旦大学生物系，1991年获中国科学院昆明动物研究所博士学位，中国最年轻的院士——张亚平，他获得科学院院士的时候年仅37岁。
主要的工作包括：

在国内较早地、系统地开展动物分子系统学的研究，深入研究灵长类、食肉类、兔形类和啮齿类的进化，在国际上建立了较为全面的熊超科分子系统树。

探讨了东亚特别是中华民族的源流和人群的迁移与分化，提出了一些新观点；在对汉族人群的线粒体基因序列分析中，发现汉族人群中存在明显的地理分化，其基本特点是，南方群体间的差异较大，北方群体间的差异较小，且南方群体中保留有较北方更多的古老类型。

和瑞典研究小组一起证实，全世界的狗具有相同的遗传基础，都起源于东亚，之后才逐渐扩散到世界各地。Science曾将他们的论文作为封面文章发表。

系统地研究了我国许多濒危和非濒危物种的遗传多样性，发现遗传多样性的缺乏与物种濒危之间没有必然的对应关系。积极将理论成果用于帮助和指导遗传多样性保护的实践，如鉴定大熊猫的父系谱系，参与大熊猫的异种克隆研究，负责其中重构胚的分子鉴定。该成果为1999年国内十大科技新闻之一。

在脊椎动物中首次发现微进化时间范围内DNA异速进化的现象。对基因起源进化的研究，揭示了一些新基因的形成和基因的变异在生物适应进化中的意义。