Affymetrix推出新一代的基因分型平台[新品推荐]

【字体: 时间:2009年10月21日 来源:生物通

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  Affymetrix近日就推出了新一代的Axiom基因分型方案,希望能配合各大测序项目所产生的遗传信息的海量增长。这种高通量、自动化的平台能帮助研究人员发现与复杂疾病相关的新型遗传变异。

这年头,啥都是新一代了,测序既然已迈入新一代,基因分型没理由落后啊。这不,Affymetrix近日就推出了新一代的Axiom基因分型方案,希望能配合各大测序项目所产生的遗传信息的海量增长。这种高通量、自动化的平台能帮助研究人员发现与复杂疾病相关的新型遗传变异。

Axiom方案将支持全基因组关联研究和候选基因关联研究,且允许一定程度的定制。研究人员将不再受限于固定模式的内容。完整的基因分型平台将采用酶介导的单碱基测序步骤,结合重复性好的高度自动化流程。

该方案经过不断验证,且融入了大规模测序项目的输出数据。最初的设计是来自人遗传变异的公共数据库,并覆盖HapMap数据,以及随后发布的其他变异。此外,Affymetrix还筛选了千人基因组计划及其他项目所发现的数百万个假定的SNP和插入/缺失,并在Axiom方案中添加了这些。

Affymetrix公司负责分析和应用开发的副总裁Keith Jones表示:“Axiom技术有能力常规筛选、验证,并将序列变异体转变成高通量分析。这个新方案的主要优势在于它能够随机获取基因组,且这种连接方法所具备的准确性。”

此方案包括Axiom阵列板,完整的Axiom试剂盒,Affymetrix和Beckman Coulter联合开发的自动化目标制备工作站,以及GeneTitan 多通道仪器。GeneTitan 多通道仪器整合了杂交炉、流体处理、CCD成像装置和分析软件,具有最大的数据重复性、用户产量和可扩展性。

Axiom平台的流程如下图:扩增200 ng总基因组DNA,并随机打断成25-125 bp的片段。将这些片段纯化,重悬,并与Axiom 基因组范围阵列板杂交。杂交之后,在严格的条件下洗涤结合物,以去除非特异的背景,将随机连接所引起的背景噪音最小化。每个多形态核苷酸都经过阵列表面的多色连接反应来拷问。连接后,阵列经过染色,并在GeneTitan™ 多通道仪器上成像。点击索取Axiom基因分型技术的更多信息

实验室有了这一套平台,只要配备一个半技术员,每周至少能处理750个样品,且用户干预极少。第一台产品预计将于本月上市,且支持全基因组关联研究。

另外,Affymetrix还通过它的科研服务实验室(ARSL)提供Axiom基因分型服务,该实验室到目前为止已经运行了超过25万个基因分型样品,其中很大一部分是Wellcome Trust病例控制协会的。(生物通 余亮)

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