11月冷泉港实验手册关注高通量基因分型[创新技巧]

每月，冷泉港实验手册都会发布若干实验手册，聚焦生物学实验的方方面面，不过是要收费的。但他们每次也会挑出2篇protocol，作为范例，供大家免费下载。11月的免费protocol是关于高通量基因分型和双分子亲和纯化（BAP）。

Protocol 1：Laboratory Methods for High-Throughput Genotyping

近年来，高通量实验方法的引进大大加速了复杂疾病遗传学的研究。它能准确高效地确定多个个体的基因型，从而让遗传研究覆盖多个变异体，而不是仅仅关注一两个变异体。芯片法基因分型分析，再加上对连锁不平衡（LD）模式的了解，刺激了复杂疾病的全基因组关联研究（GWAS）。近年来，GWAS成功鉴定出多个影响患病风险的基因，显示出这项技术的巨大潜力。高通量基因分型中的关键问题是根据你的目标和实验阶段选择合适的技术。

本文介绍了高通量SNP基因分型中常用的几种方法，适合遗传研究的不同阶段，并简要回顾了一些高通量测序方法。简单说来，文中讨论了三类研究：候选基因、连锁分析和GWAS。不同的技术适合不同的项目和规模，请看下图。技术不同，通量不同，每个SNP基因型的费用也有差异。详细内容请点击标题查看。

Protocol 2：Bimolecular Affinity Purification (BAP): Tandem Affinity Purification Using Two Protein Baits

串联亲和纯化（TAP）技术首先在酵母中运用，以纯化和鉴定蛋白复合物。尽管亲和纯化较易操作，但非特异的蛋白相互作用会影响真实模式的鉴定。为了缓解这个问题，人们开始在TAP过程中采用两步连续的亲和纯化。最初在酵母中实践，慢慢地这种技术经过修改，也延伸到其他的物种，包括哺乳动物。在这个实验手册中，作者们对TAP技术有了一些改动，将亲和部分放置在复合物中的两个不同蛋白上，以检测或分离复合物中的成分。他们将此称之为双分子亲和纯化（BAP），适用于纯化有两个已知成分的复合物。BAP与TAP的比较请看下图。