冷泉港发布7月份实验手册[创新技巧]

冷泉港于近日发布了7月份的实验手册，当然，其中有两个是免费的。它们分别讲述了如何利用FISH和数码图像分析来定量样品中不能培养的微生物；以及快速高效地制备有粘性的微单元，来控制单个的细胞形状和粘附模式。

其一：Use of Fluorescence In Situ Hybridization and the daime Image Analysis Program for the Cultivation-Independent Quantification of Microorganisms in Environmental and Medical Samples

在测量微生物丰度时，传统的方法是培养，但这种方法显然不适合未培养的微生物，而这种微生物在很多环境或医学样品中占了大部分。现在，问题已经解决了。奥地利维也纳大学微生物生态系的Holger Daims利用荧光原位杂交（FISH）、rRNA-靶定的探针和数码图像分析来定量微生物。通过测量随机记录的图像对中探针标记的生物量的面积，能毫无偏向性地估计出目的群体的相对生物量。这种方法以“生物量分数”（相对于整个微生物群体的总生物量）来表达丰度。这个数值相当于目的群体的生物反应空间，因此比绝对的细胞数目更具有生态相关性。另一个优势在于这种方法完全不依赖于微生物的形态。不管目标微生物是以何种形式存在，这种不依赖培养的方法都能测定复杂微生物群体的组成。

其二：Adhesive Micropatterns for Cells: A Microcontact Printing Protocol

这篇文章描述了如何快速高效地制备有粘性的微单元，来控制单个的细胞形状和粘附模式。整个过程可分为三步。首先，制作一个硅的母板，上面包含了感兴趣的微特征。其次，制作一个聚二甲基硅氧烷（PDMS）的模具。这一步不需要任何特殊的设备。PDMS模具与细胞外基质蛋白相连。蛋白印在底物上，而未印制的区域就回填多聚赖氨酸聚乙二醇，它能够排斥细胞粘附。后面的部分描述细胞的沉积。此份实验手册是由法国居里研究所的Manuel Théry和Matthieu Piel提供的。

（生物通 余亮）