PLoS ONE等多篇文章解析关键病毒研究进展

【字体: 时间:2010年01月19日 来源:生物通

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  早年毕业于法国奥尔良大学的Vincent DEUBEL博士对病毒学研究情有独中,多年来他一直从事着致病病毒的研究,近期其研究组获得了这方面的多项新成果。

  

生物通报道:早年毕业于法国奥尔良大学的Vincent DEUBEL博士对病毒学研究情有独中,多年来他一直从事着致病病毒的研究,近期其研究组获得了这方面的多项新成果。

第一篇文章发表在《Journal of Clinical Virology》(临床病毒学杂志)上,研究人员通过各种实验手段,深入研究博卡病毒在病毒学及免疫学上的特性,发现了人博卡病毒感染与体液免疫反应的关系,以及在患有急性呼吸道感染的儿童中,博卡病毒与其他呼吸道病毒的高共感染性。这引起我们对该病毒适应宿主和协助其他病毒感染的可能性的警惕。

博卡病毒是一种新发现的细小病毒。2005年,瑞典实验室从下呼吸道感染的儿童体内发现了人博卡病毒。自此以后,世界各地纷纷在呼吸道,血液,粪便,尿液等处发现博卡病毒。有呼吸道病症的患者感染博卡病毒的几率明显比正常人高,但同时,博卡病毒阳性患者常常发现有其他病毒共感染现象。因此,人博卡病毒是否会引起呼吸道疾病还有争议。

经过两年时间,研究组从上海南翔医院共获得817例样本,并做了12例回访病例研究。研究发现,人博卡病毒在该群患儿中阳性率高达11.8%,仅次于流感病毒以及呼吸道合胞病毒;小于2岁的患儿,博卡病毒的检出率大大高于年长患儿;然而,抗博卡病毒IgG阳性率却随着患儿年龄增加而逐步上升。这证明了博卡病毒可能在幼儿期有很高的感染率。

研究发现,博卡病毒与其他呼吸道病毒的共感染率可高达51%,且更多地出现在那些只有低拷贝博卡病毒的患儿样品中。博卡病毒可以以低拷贝数长期存在于呼吸道,血液以及尿液中达一个月之久。而共感染现象在这些长期感染博卡病毒的病人中十分普遍。本研究提出了急性博卡病毒感染可以导致系统性感染,引起免疫反应,并最终表现为患儿的呼吸道疾病。

第二项研究发表在PLoS ONE杂志上,这篇文章首次在一种新病毒-鼻病毒C中发现大量多重重组。

鼻病毒和流感病毒,呼吸道合胞病毒是儿童呼吸感染主要致病病毒。鼻病毒分为3种亚型:即HRV-A, HRV-B和HRV-C亚型。2006年美国首次发现了HRV-C。上海巴斯德研究所新生病毒研究组研究人员与上海南翔医院儿科合作,通过系统研究急性呼吸道感染致病病毒,发现HRV-C在所有鼻病毒感染病例中占50 %以上。其中,一半以上含有一个长度不一属于HRV-A的5’端的基因片段。该发现表明HRV-C可以分为两个新亚种。通过新亚种全基因组测序,研究人员还发现了基因组其他位置的重组点。此外,分析表明HRV-A和HRV-C共感染可能是产生病毒重组的原因。

这项研究同时证明儿童人群存在鼻病毒高遗传多样性,该样本人群在同一医院就诊,来自有一百万居民的同一社区,其中40%是外来人口。这表明,鼻病毒在这样的社区内有很高的进化能力。鼻病毒C主要是在支气管炎和肺炎门诊儿童病人中发现的,然而,重组导致5 '端非编码区二级结构变化对病毒扩增周期的影响尚未确定,因为它无法进行细胞培养也不能感染小鼠。这项研究首次提出,与脊髓灰质炎病毒相似,不同鼻病毒有重组能力。导致极大的病毒多样性,从而使病毒诊断和分离更加困难。

另外DEUBEL博士研究组在09年早期还发现了可用于A型流感HA基因亚型分型的多重荧光PCR方法。研究人员建立了4组荧光RT-PCR反应体系,结合SYBR染料标记,Taqman探针和分子信标技术,可以一次鉴别A型流感M基因和6种HA基因亚型(H1, H2, H3, H5, H7, H9)。该6种HA亚型可以感染人,鸟和猪。该方法检测敏感度可达到10-100个病毒RNA拷贝数,可检测出至少6种东南亚地区H5亚型。这一方法并已通过临床标本验证。结合Smartcycler荧光PCR仪,该方法建立了一个快速有效,灵活可靠的A型流感监测平台,可用于医院和野外现场调查。

(生物通:万纹)

作者简介:

附:

Vincent DEUBEL
博士,研究员
Email:vdeubel@sibs.ac.cn


教育经历
1985年: 法国巴黎第七大学科学博士(病毒学)
1973年: 法国奥尔良大学第三阶段博士(生物物理)
1971年: 法国奥尔良大学科学硕士(生物化学)
任职经历
2004-至今: 中科院上海巴斯德研究所所长、新生病毒研究组负责人
2001年-2004年: 法国里昂巴斯德研究所病毒性传染病室负责人(国家参照中心及世界卫生组织虫媒病毒流行性出血热合作中心)
2000年-2003年: 里昂"让.梅里约"P-4 实验室科学主任
里昂梅里约-巴斯德研究中心科学主任
1999年-2000年: 法国巴黎巴斯德研究所病毒学部主任
1993年-2000年 法国里昂巴斯德研究所病毒性传染病室负责人(国家参照中心及世界卫生组织虫媒病毒流行性出血热合作中心)
1989年-1992年: 法国巴黎巴斯德研究所虫媒病毒实验室主任(国家参照中心及世界卫生组织合作中心)
1987年-1988年: 法国巴黎巴斯德研究所分子病毒学实验室副教授(Marc Girard教授)
1985年-1987年: 美国科罗拉多州科林斯堡疾病控制中心分子病毒学实验室研究人员(Dennis W Trent教授)
1979年-1985年: 塞内加尔达喀尔巴斯德研究所病毒实验室主任
1977年-1979年 法国巴黎巴斯德研究所病毒生态学实验室研究助理 (Claude Hannoun教授)

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