施一公《Nature》开年之作 AdiC机制

【字体: 时间:2010年01月22日 来源:生物通

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  清华大学生命科学院生物膜与膜生物工程国家重点实验室、蛋白质科学教育部重点实验室的科研人员在氨基酸反向转运体在酶作用底物的识别和转运机制的研究方面取得新的进展,相关成果文章Mechanism of substrate recognition and transport by an amino acid antiporter发布在Nature在线版上。

  

生物通报道,清华大学生命科学院生物膜与膜生物工程国家重点实验室、蛋白质科学教育部重点实验室的科研人员在氨基酸反向转运体在酶作用底物的识别和转运机制的研究方面取得新的进展,相关成果文章Mechanism of substrate recognition and transport by an amino acid antiporter发布在Nature在线版上。

 

文章通讯作者是清华大学生命科学院院长施一公教授,主要运用结构生物学和生物化学的手段研究肿瘤发生和细胞调亡的分子机制,集中于肿瘤抑制因子和细胞凋亡调节蛋白的结构和功能研究、重大疾病相关膜蛋白的结构与功能的研究、胞内生物大分子机器的结构与功能研究。

 

在极端的酸性环境中,肠道菌如,大肠杆菌(Escherichia coli)主要精氨酸依赖的精氨酸:胍丁胺反向转运蛋白(AdiC),该转运体可将细胞内的质子排出。施一公教授曾首次报道E. coli O157: H7AdiC转运蛋白和一种氨基酸/聚胺/有机金属阳离子(APC)超家族转运蛋白的晶体结构。研究表明,AdiC的整体折叠结构与几种Na+依赖性转运蛋白相似,由12个跨膜片段组成二聚体结构位于晶体外表面的开放结构中,形成一个保守的开向外周细胞质的酸性口袋。进一步结构和生化分析揭示了AdiC与配体结合的必要残基,确定了质子转运的路径,并预示反转运蛋白可能具有保守的转运机制。

 

AdiC是氨基酸/聚胺/有机金属阳离子(APC)超家族转运蛋白家族中的一种,尽管AdiC的折叠结构等方面的研究已经取得进展,但是,关于AdiC识别底物(精氨酸或胍丁胺)的机制还不清楚。

 

在本研究中,我们分析了大肠杆菌E.ColiAdiCAgr3.0埃分辨率的射线中的结构。正电荷的Arg结合在酸性的位点上,Arg的结合会诱导显著的结构重排,包括TM6TM2TM10,导致构象发生变化。

 

这些研究对解释Adic的运作机制具有重要的意义。

(生物通 小茜)

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Mechanism of substrate recognition and transport by an amino acid antiporterNature advance online publication 20 January 2010 | doi:10.1038/nature08741;

 

施一公 博士

 

教授,博导,长江讲座教授,国家杰出青年基金获得者

 

1985-1989  清华大学生物科学与技术系,学士

1990-1995  美国约翰霍普金斯大学医学院,分子生物物理学博士

1995       美国约翰霍普金斯大学医学院,博士后

1996-1997   美国史隆凯特林癌症研究中心结构生物学实验室,博士后

1998-2001  美国普林斯顿大学分子生物学系,助理教授

2001-2003  美国普林斯顿大学分子生物学系,(终身)副教授

2003-2008  美国普林斯顿大学分子生物学系,(终身)教授

2007-2008  美国普林斯顿大学分子生物学系,Warner-Lambert/Parke-Davis教授

2008-至今      清华大学生命科学学院,教授、博导

 

主要科研领域与方向:

主要运用结构生物学和生物化学的手段研究肿瘤发生和细胞调亡的分子机制,集中于肿瘤抑制因子和细胞凋亡调节蛋白的结构和功能研究

与重大疾病相关膜蛋白的结构与功能的研究

细胞内生物大分子机器的结构与功能研究

 

Selected Publications in last 5 years:

 

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Feng Wang, Ziqing Mei, Yutao Qi, Chuangye Yan, Siheng Xiang, Zhiyuan Zhou, Qi Hu, Jiawei Wang, and Yigong Shi. (2009) Crystal structure of the MecA degradation tag. JBC [Epub ahead of print: Oct 2, 2009]

Ziqing Mei, Feng Wang, Yutao Qi, Zhiyuan Zhou, Qi Hu,, Han Li, Jiawei Wu, and Yigong Shi. (2009) Molecular determinants of MecA as a degradation tag for the ClpCP protease. JBC [Epub ahead of print: Sep 18, 2009]

Xiaochun Li, Boyuan Wang, Lihui Feng, Hui Kang, Yang Qi, Jiawei Wang, and Yigong Shi. (2009) Cleavage of RseA by RseP requires a carboxyl-terminal hydrophobic amino acid following DegS cleavage. PNAS 106: 14837-42 [Epub:Aug 17, 2009]

Fan Zhang, Zhuoru Wu, Ping Zhang, Geng Tian, Dan Finley, and Yigong Shi. (2009) Mechanism of substrate unfolding and translocation by the regulatory particle of the proteasome from Methanocaldococcus jannaschii. Molecular Cell 34: 485-96

Fan Zhang, Min Hu, Geng Tian, Dan Finley, Phil Jeffrey, and Yigong Shi. (2009) Structural insights into the regulatory particle of the proteasome from Methanocaldococcus jannaschii. Molecular Cell 34: 473-84

Xiang Gao, Feiran Lu, Lijun Zhou, Shangyu Dang, Linfeng Sun, Xiaochun Li, Jiawei Wang, and Yigong Shi. (2009) Structure and mechanism of an amino acid antiporter. Science 324:1565-8 [Epub: May 28, 2009]

Xu Zhang, Jiawei Wang, Chao Fan, Husheng Li, Honghong Sun, Shunyou Gong, Youhai Chen, and Yigong Shi. (2009) Crystal structure of TIPE2 provides insights into immune homeostasis. Nature Structural & Molecular Biology 16: 89-90 [Epub: Dec 14, 2008]

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