特聘教授最新文章解析基因检测新方法

　　

生物通报道：来自美国哈佛大学波士顿儿童医院的研究人员找到了一种新的基因诊断方法——染色体微阵列分析，可使孤独症的基因诊断效率比以前提高3倍。这一研究成果公布在《J Card Fail》杂志上。

领导这一研究的是哈佛大学医学院儿童医院吴柏林博士，其主要研究方向遗传医学和基因组医学, 基因诊断和分子病理。吴柏林教授现任复旦大学特聘教授，生物医学研究院高级PI，医学院和儿科医院双聘教授，哈佛医学院波士顿儿童医院研究员，基因诊断研究室主任等。

怎样早期发现孩子患有孤独症？基因检测是目前一种有效手段。尽管只有15%的孤独症患者可以发现明确的基因根源，但对于有家族史的家长而言，基因检测仍然是预见疾病的一个有效手段。目前第一线的遗传诊断方法（染色体核型分析）只能诊断出2.23%的儿童孤独症患者，而其它的基因检测单个大都不足1%。

在这篇文章中，研究人员发现染色体微阵列分析可使孤独症的基因诊断效率比以前提高3倍，对整个基因组序列进行更细致的检查，使基因诊断的效率一下提升到7.3%，也就是说150万的7%就超过10万名儿童。

吴柏林博士从2006年起，就带领团队与美国多个研究机构合作，开展儿童孤独症研究，包括研发以基因芯片新技术为基础的高效率基因检测。两年多前，他们就用这个新方法发现了染色体16p11.2可重复发生的基因组失衡与儿童孤独症相关。这一成果开创了将基因芯片检测应用于儿童孤独症早期诊断的先河。目前该新方法积累的临床病例样本已近1000名，年龄段从13个月到22岁。

之前吴柏林博士和哈佛大学麻省总医院人类遗传研究中心及儿童医院研究员沈亦平博士合作，获得了“染色体16p11.2缺失或重复与自闭症密切相关”的新成果，该项研究由哈佛大学麻省总医院和哈佛大学儿童医院为主体的大协作研究（包括美国波士顿地区14个大学、研究所、医院组成的“自闭症研究协作组”、约翰·霍普金斯大学、冰岛deCODE研究所，以及美国自闭症协会的病人数据库），采用了基因芯片的最新技术，分析了最大数量的自闭症患者和家属（近4000人）及对照组（20000多名）。

科学家们比较分析了三个团队应用不同的技术平台独立完成的病例研究，共发现了13例缺失和11例重复。这些微小异常都发生在16号染色体的同一位点。进一步研究证实，这段区域含约60万个DNA序列碱基对，包括25个基因。首次将自闭症的发病与这一热点区相关联，为进一步定向研究这25个基因开辟了道路。

（生物通：万纹）

原文摘要：

Familial Dilated Cardiomyopathy Secondary to Dystrophin Splice Site Mutation.

BACKGROUND: Idiopathic dilated cardiomyopathy (DCM) encompasses a heterogeneous group of disorders, posing significant diagnostic challenges. Genetic etiologies underlie an important subset of DCM, including 20 genes and 5 X-linked disorders to date. We report a family with a rare dystrophin gene alteration, identified after evaluation of asymptomatic children whose extended family history included cardiomyopathy, premature cardiac death, or cardiac transplantation. METHODS AND RESULTS: Record review, clinical evaluations, and DNA samples were obtained from members of a 5-generation pedigree with early onset DCM. Five of 6 affected males experienced death or cardiac transplant in their second or third decades. No affected individuals had skeletal muscle weakness before acute cardiac decompensation. Dystrophin gene analysis of an affected family member revealed sequence alteration at the conserved 5' splice site of exon 1 of the muscle-specific isoform of dystrophin (IVS1 +1 G>T) and co-segregated with cardiac disease in this family. CONCLUSIONS: Young males presenting with apparent isolated cardiomyopathy or acute myocarditis may harbor dystrophin mutations without overt skeletal muscle pathology. The etiology of familial risk was not evident in this pedigree before retrospective cardiovascular genetics assessment, highlighting ongoing diagnostic challenges and limitations of standardized screening panels (which do not include dystrophin) in patients with "idiopathic" DCM. Copyright © 2010 Elsevier Inc. All rights reserved.

作者简介：

吴柏林博士, 哈佛大学波士顿儿童医院研究员、临床分子诊断专科医学主任、基因诊断研究室主任、分子遗传病理主任; 哈佛大学医学院病理学助理教授、临床遗传和分子病理博士后指导教授。2003年选为美国医学遗传学院专家委员(FACMG); 2007年选为美国华人遗传学家学会(ACGA)会长。2005年起兼任复旦大学生命科学学院、上海医学院和儿科医院客座教授。

吴柏林教授的主要研究方向遗传医学和基因组医学, 基因诊断和分子病理。最新的研究包括率先研发了可用于临床的全基因组高分辨高通量微阵列基因芯片,成功地发现了两个与孤独症发病相关的可重复发生的遗传病因, 在与基因组失衡相关的出生缺陷和发育性疾病的遗传病因鉴定及研发相应的临床基因诊断的转化医学研究方面走在世界前列。

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代表论文

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·Miller DT, Shen Y, Weiss LA, Korn J, Anselm I, Bridgemohan C, Cox GF, Dickinson H, Gentile J, Harris DJ, Hegde V, Hundley R, Khwaja O, Kothare S, Luedke C, Nasir R, Poduri A, Prasad K, Raffalli P, Reinhard A, Smith SE, Sobeih MM, Soul JS, Stoler J, Takeoka M, Tan W-H, Thakuria J, Wolff R, Yusupov R, Gusella JF, Daly MJ, Wu B-L: Microdeletion/duplication at 15q13.2q13.3 among individuals with features of autism and other neuropsychiatric disorders. J Med Genet (Published Online First: 19 September 2008. doi:10.1136/jmg.2008.059907).