Nature Science新宠 微生物基因组

　　

生物通报道，2007年Science杂志预测，人体微生物的研究可能成为国际科学家们的新热点课题，时间过去3年，这一预测就得到实现，随着肠道微生物基因组计划，肠道微生物与代谢疾病的研究步伐的加速，肠道微生物研究受到空前的重视，近期Nature和Science分别发表了两篇重要的研究论文。

 

Nature封面文章

为彰显重要性，Nature的这篇论文以封面的形式发表。该研究属于欧盟第七框架资助项目——人体肠道元基因组研究计划（MetaHIT）的一部分，深圳华大基因研究院作为唯一的非欧盟研究团体参与到MetaHIT计划中，采用高通量的测序技术和高效能的信息分析平台，取得了一系列突破性的研究成果。

 

体除受自身基因的调控外，还受到大量的共生细菌的影响。这些细菌大部分寄生在人的肠道中，通称为肠道菌群，在学术界常被称作“人体肠道元基因组”。该项研究成果收集了124个来自于欧洲人肠道菌群的样本，采用了新一代大规模高通量的测序技术进行深度测序，产出近6千亿的碱基序列。经过序列组装和基因注释分析，从中获得330万个非冗余的人体肠道元基因组的参考基因，约是人自身基因的150倍。这个基因集中包含了绝大部分目前已知的人体肠道微生物基因，但更多的是目前未知微生物的基因。从这个基因集中可以估计人肠道中存在约1000到1150种细菌，平均每个体内约含有160种优势菌种，并且这些细菌是绝大部分个体所共有的。

 

深圳华大基因研究院与MetaHIT计划的众多合作单位一起，正在开展更深入的研究以揭示肠道菌群的基因组成与肥胖、肠炎病的关系。此外，深圳华大基因研究院还与北京大学深圳医院展开合作，携手进行人体肠道菌群与糖尿病的关联分析。种种这些研究不仅将对人类自身健康与体内微生物的微妙关系做出科学的诠释，也更有助于预防、监控和干预由肠道菌群引发的肥胖、肠炎和糖尿病等疾病。我们相信，基于肠道元基因组的个体化医疗时代已不遥远。

 

Science肠道微生物影响代谢

Emory大学病理系，医学系，康奈尔大学微生物系，Howard Hughes医学研究所的科学家在一项新研究中发现，我们肠道的微生物以及调控这些微生物的我们免疫系统的分支可能与代谢综合症（这是一组与肥胖症有关的代谢问题，他们会增加一个人罹患糖尿病和心脏病的风险）有部分的关系。

 

这一研究是建立在最近发现的肠道微生物的组成与肥胖症有关的基础之上的。 这项由Matam Vijay-Kumar及其同僚所开展的新的研究工作提示，先天免疫系统（即保护身体不受微生物病原体的侵害）可能是肠道微生物系与代谢作用之间的桥梁。

 

附

2010年MetaHIT国际会议

２００多名国际顶尖科学家参加由华大基因主办的２０１０年ＭｅｔａＨＩＴ国际会议。该会议为人类认识自身健康和疾病与肠道微生物之间的联系提供新的理论依据，并为科学家们交流宏基因前沿进展，探讨微生物未来方向提供了崭新平台。

 

ＭｅｔａＨＩＴ（人类肠道宏基因组计划）计划是由欧盟第七框架计划资助的子项目之一。该项目的合作伙伴包括了来自中国、美国、丹麦、法国、日本、西班牙、英国、芬兰８个国家学术界和工业界的１３个成员。深圳华大基因研究院目前承担了ＭｅｔａＨＩＴ计划中的２００多个欧洲人肠道微生物样品的测序及后续生物信息分析工作。

 

深圳华大基因研究院副院长王俊博士在会上作了题为《基于高通量测序的宏基因组学研究――人体相关微生物研究的新方法》的发言。深圳华大基因研究院近年所取得的多项科研成果，令与会专家产生浓厚兴趣，并表示热切关注。

 

据了解，ＭｅｔａＨＩＴ计划的目的是研究人类肠道中的所有微生物群落，进而了解人肠道中细菌的物种分布，最终为后续研究肠道微生物与人的肥胖、肠炎、糖尿病等疾病的关系提供非常重要的理论依据，达到预防和监控的目的。王俊表示，ＭｅｔａＨＩＴ计划的完成，将极大地推动宏基因组学研究的快速发展，使得大规模的宏基因组学研究相继展开，大量新的微生物种群和新的基因将得以发现，对人类健康将有积极的现实意义。

（生物通 小茜）

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